ARB
Class Index
A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Z | _
  A  
CompareByLength   GroupMatchScorer   ReadRule (FieldTransfer)   ali_prealigner_cell   
Complement   GroupNameQueryKey   ReadSeqVars   ali_prealigner_column   
AbsLoc   ComplementLocation   GroupPenalty   RealignAttempt   ali_prealigner_mask   
AdaptedAlignmentTransporter   CompountT   GroupRename_callenv   Realigner   ali_pt_member   
AISC_Object   CompountT< R()>   GroupSearch   RecalcNeeded   alist   
ALI_ALIGNER   CompountT< R(P1)>   GroupSearchCommon   RecordingMacro   apd_sequence   
ALI_ALIGNER_CONTEXT   CompountT< R(P1,...)>   GroupSizeKey   Rectangle (AW)   arb_handlers   
ALI_ARBDB   CompountT< T & >   GroupUIdata   RefContainer   arb_params   
ALI_GLOBAL   CompountT< T * >   GroupXfer_callenv   Reference   arb_prm_struct   
ALI_MAP   CompountT< T C::* >   GroupZombiesKey   References   arb_progress   
ALI_NORM_SEQUENCE   CompountT< T[]>   
  H  
ReferringEntriesHandler (RefEntries)   arb_r2a_pro_2_nuc   
ALI_PATHMAP   CompountT< T[N]>   RefPtr   arb_r2a_pro_2_nucs   
ALI_PREALIGNER   CompressionRoot   HasLevelSmallerThan   Refs   arb_status_implementation   
ALI_PREALIGNER_CONTEXT   ConfigDefinition   HasntCurrentClusterPrefix   RefSelector (RefEntries)   arb_suppress_progress   
ALI_PROFILE   ConfigDeleter   Header   RegExpr   asserter (arb_test)   
ALI_PROFILE_CONTEXT   ConfigMapping   HeaderList   RegFieldSelection   auto_delete_array_ptr   
ALI_PT   ConfigModifier   HelixNrInfo   RegMatch   auto_delete_ptr   
ALI_PT_CONTEXT   ConfigRenamer   Helpfile   RequiresActionTracker   auto_free_ptr   
ALI_selection   Consensus   Hit   ResourceStack   aw_stg_struct   
ALI_sellst_spec   ConsensusBuildParams   HitCounter   RNA3D_Global   aw_toggle_data   
ALI_SEQUENCE   ConsensusReference   Host (ARB_type_traits)   RNA3D_Graphics   aw_xargs   
ALI_SUB_SOLUTION   ConsensusTree   Hs_struct   RootAsWindowCallback   awar_vars   
ALI_TARRAY   ConsensusTreeBuilder   
  I  
RSpecSet   awModDef   
ALI_TLIST   ConstParamT   Rule (FieldTransfer)   awt_assignment   
ALI_TLIST_ELEM   ConstParamT< T * >   ID_checker   RulerScaler   awt_check_box   
ALI_TSTACK   ConstParamT< void >   IfThenElseType   RuleSet (FieldTransfer)   awt_hotkeys   
AliAdmin   ConstStrArray   IfThenElseType< false, T, F >   
  S  
awt_input_field   
AliApplicable   ConsumeUDC   IfThenElseType< true, T, F >   awt_input_handler   
AliAutoFormatCommand   ConsumeUDC< T, false >   Importer   S_cfgLine   awt_input_mask_global   
AliChange   ConsumeUDC< void, convert_possible >   ImportFieldScanner   S_Frand   awt_input_mask_id_list   
AliCompositeCommand   Convaln_exception   ImportSession   S_RNS   awt_item_type_selector   
AliData   ConvertibleData   ImportTestData   S_Spreading   awt_linked_to_item   
AliDataSlice   Counted   InfoWindow   SAI_graphic   awt_mask_action   
AliDeleteCommand   CurrSpecies   InfoWindowRegistry   SAI_selection   awt_mask_awar_item   
AliEditCommand   CursorPos   InputFileError   SAI_sellst_spec   awt_mask_item   
AliEditor   
  D  
InputFormat   SAI_string_builder   awt_numeric_input_field   
AliEntryCounter   InsertData   SaiAciApplicator   awt_radio_button   
AlignBuffer   Data   Insertions   SaiBoolchainOperator   awt_string_handler   
AlignDataAccess   DataLoc   InsertPerfMeter   SaiBoolRule   awt_text_viewport   
Aligner   DB_scalable   Int   SaiCalcEnv   awt_variable   
Alignment   DBerror   Interpreter   SaiCalculator   awt_viewport   
AlignmentReference   DBID   IRS_data   SaiOperator   awXKeymap   
AlignmentTransporter (FieldTransfer)   DbQuery (QUERY)   IsCallback   Sampler   awXKeymap_modfree   
AlignParams   DbScanner   IsClassT   Sax2Handler   
  b  
AliInsertCommand   DBwriter   IsEnumT   Scaler   
AliNameAndType   DecisionTree   IsFunctionT   ScopedTransporter   binop_pair   
AliView   DefaultHandler   IsFundaT   SCP_Less   bytestring   
Ambiguity (chartable)   DefinedCommands   IsSpecificCallback   ScrollSynchronizer   
  c  
AN_gl_struct   DelayReshade   IsSpecificHierarchyCallback   SearchAwarList   
Angle (AW)   Deletable   Item   SearchedTree   cached_taxonomy   
AngleBuffer   DendroSubtreeLimits   ItemClonedByRuleSet (FieldTransfer)   SearchFIFO   case_op   
AP_combinableSeq   DepthMarker   Itemfield_Selection   SearchParameter   PT_statistic::chain_head_mem   
AP_DefaultTreeShader   Desco (validNames)   ItemFieldShader   SearchRelativeParams   charpLess   
AP_filter   DesignTargets   ItemShader   SearchRelativesReference   cilist   
AP_main   DI_ENTRY   
  J  
SearchSettings   client_msg_queue   
AP_matrix   DI_GLOBAL_MATRIX   SearchTree   cllist   
AP_pos_var   DI_MATRIX   JoinedLocation   SearchTreeNode   cmp_candidates   
AP_rates   Dict   
  K  
SEC_base   cmp_Rectangles   
AP_sequence   DictData   SEC_base_iterator   color_save_data   
AP_sequence_simple_protein   DictTree   Keeper   SEC_base_part   column   
AP_smatrix   DiffLines   KeyInfo   SEC_base_part_iterator   common_filter_params   
AP_STACK   DisplayFormat   KeySorter   SEC_bond_def   comparator   
AP_subtree   DistanceCounter   KL_params   SEC_constrainted   compare_by_criteria   
AP_tree   Distributor   KL_Settings   SEC_db_interface   complex   
AP_tree_edge   DNA_Table   
  L  
SEC_dbcb   consensus_result   
AP_tree_folding   DontTransportAlignment   SEC_displayParams   containing (arb_test)   
AP_tree_members   Dots   Label   SEC_drawn_positions   copy (arb_test)   
AP_tree_root   Dragged   Lazy   SEC_oriented   copy< const char * > (arb_test)   
AP_TreeShader   DragNDrop   LazyAliData   SEC_region   copy< copy< T > > (arb_test)   
AP_userdef_matrix   DupCriteria   LazyFloat   SEC_root   count_mutpsite   
AP_weights   DuplicateLinkFilter   LazyPersistantFlag   SEC_segment_iterator   count_nothing   
ARB_countedTree   DupNameCriterion   LeafRelation   SEC_seq_data   count_unweighted   
ARB_edge   
  E  
TreeNode::LengthCollector   SEC_strand_const_iterator   count_weighted   
ARB_ERROR   LikelihoodRanges   SEC_strand_iterator   counter   
ARB_inc_sleep   ED4_abstract_group_manager   LimitedTime   SEC_structure_toggler   counter (ArbProgress)   
ARB_init_perl_interface   ED4_abstract_sequence_terminal   LimitTracker   SelectedDatabase   cursorpos   
ARB_seqtree   ED4_area_manager   LineAttachedMessage   SelectionListSpec   custom_dealloc_ptr   
ARB_seqtree_root   ED4_base   LineBuf   SepBaseFreq (chartable)   customCriterion   
ARB_TIME   ED4_base_position   LinePart   Seq   
  d  
ARB_timeout   ED4_block   LineQueue   SeqInfo   
ARB_timestamp   ED4_block_operator   LineReader   SeqPart   db_interrupt_data   
ARB_tree_info   ED4_bracket_terminal   LineVector (AW)   Sequence   debug_asserter (arb_test)   
ARB_tree_predicate   ED4_cb_list   Link   SequenceAliData   dereference   
ArbCachedString   ED4_consensus_sequence_terminal   List   SequenceBuffer   dereference< T * >   
ARBDB_connector   ED4_container   ListDisplayRow   SequenceHandler   dereference< T *const >   
ARBDB_memory_manager   ED4_coords   LoadSaveSearchParam   SequenceIterator   di_protdist   
ArbDBWriter   ED4_cursor   LocallyModify   SequencePosition   diff_params   
ArbImporter   ED4_CursorShape   Location   SetOnce   different_types   
ArbMatchResult   ED4_device_manager   LocationEditor   Setup (iupac)   difflineMode   
ArbMatchResultsManager   ED4_Edit_String   LongBranchMarker   SetVariables   disallow_type   
ArbParsimony   ED4_extension   LooseBases   ShaderPlugin   dot_insert_stat   
ArbPC_Context   ED4_foldable   LowDataCheck   ShallBeDeleted   double_xfer   
ArbPM_Context   ED4_folding_line   
  M  
ShowHelix_cd   doublecomplex   
ArbProbe   ED4_group_manager   SimpleFormatReader   drawdata   
ArbProbeCollection   ED4_host   MackeParser   SimpleLocation   dt_bondssum   
ArbProbeMatchWeighting   ED4_line_terminal   MackeReader   SimpleRoot   
  e  
ArbRefCount   ED4_list   MacroRecorder   SimpleTester   
ArbStringCache   ED4_list_elem   MacroTalkSleep   SingleDictTree   ed_key   
ArbTcpDat   ED4_LocalWinContext   MarkedPrefixes   SizeAwarable   epsilon_similar (arb_test)   
ArbWriteFile_Context   ED4_manager   MarkerDisplay   SizeAwareRoot   equals   
ArgParser   ED4_MostRecentWinContext   MarkerIdentifier   SizedBufferPtr   expectation (arb_test)   
AttributeParser   ED4_move_info   MarkerPosition   SizedCstr   expectation_group (arb_test)   
AutoMatchSettings   ED4_multi_name_manager   MarkerXPos   SizeOverOne   export_environment   
AvailableFieldScanner   ED4_multi_sequence_manager   MaskCommandDefinition   SlaveCanvas   export_format   
AW_area_management   ED4_multi_species_manager   MasterCanvas   SlaveCanvas_internal   export_sequence_data   
AW_at   ED4_name_manager   MasterSequence   SmartPtr   
  f  
AW_at_auto   ED4_objspec   MatchingOligo   Smoother   
AW_at_maxsize   ED4_objspec_registry   MatchRequest   Socinf   fallbacks   
AW_at_size   ED4_orf_terminal   MatrixDisplay   Sonde   filter_params   
AW_at_storage   ED4_plugin_host   MatrixOrder   Sondentopf   for_data   
AW_awar   ED4_reference   MaxBond   SortByTopo   format_props   
AW_buttons_struct   ED4_reference_terminals   MemBlock   SortClusterIDsBy   formatTable   
AW_cb   ED4_remap   MemBlockManager   SortedFreq   fragment   
AW_CL_castableType   ED4_root   MemDump   Spec (TreeAdmin)   
  g  
AW_click_cd   ED4_root_group_manager   Memory   SpeciesConcatenateList   
AW_clicked_box   ED4_scroll_links   MergeFieldScanner   SpeciesFlag   g_b_undo_entry   
AW_clicked_element   ED4_scroll_picture   MessageAttachable   SpeciesFlags   g_b_undo_gbd   
AW_clicked_line   ED4_scrolled_rectangle   MetaInfo   SpeciesInTwoTrees   g_b_undo_header   
AW_clicked_text   ED4_SearchPosition   MetaTag   SpeciesMergeList   g_b_undo_list   
AW_clip_scale_stack   ED4_SearchResults   MetaTagTranslator   SpeciesSelector   g_b_undo_mgr   
AW_clipable   ED4_selection_entry   MG_remap   SpecificAliData   gb_buffer   
AW_common   ED4_seq_colors   MG_remaps   SpecificGap   gb_cache   
AW_common_Xm   ED4_sequence_manager   Mismatches   SpecSet   gb_cache_entry   
AW_DB_selection   ED4_sequence_terminal   MismatchWeights   SpecSetRegistry   gb_callback   
AW_device   ED4_species_pointer   MITuple   Splits   gb_callback_list   
AW_device_size   ED4_terminal   MO_Liste   Spoolable   gb_compress_list   
AW_event   ED4_TerminalPredicate   MO_Mismatch   SpoolableColor   gb_compress_tree   
AW_font_group   ED4_text_terminal   ModRLimit   SpoolableString   gb_data_base_type_union   
AW_font_limits   ED4_update_info   MostLikelySeq   SPOOLER   gb_data_base_type_union2   
AW_font_overlap   ED4_WinContext   MostUsedPos   SQ_ambiguities   gb_data_list   
AW_GC   ED4_WinContextFree   MP_list_elem   SQ_GroupData   gb_db_extended   
AW_GC_config   ED4_window   MP_Main   SQ_GroupData_Impl   gb_exitfun   
AW_gc_manager   ED4_work_info   MP_Window   SQ_GroupData_PRO   gb_extern_data   
AW_GC_set   EDB_root_bact   MultiFastaWriter   SQ_GroupData_RNA   gb_extern_data2   
AW_GC_Xm   EdgeBetween   MultiFieldReader   SQ_helix   gb_flag_types   
AW_helix   EdgeChain   Multitype   SQ_physical_layout   gb_flag_types2   
AW_hsv   EdgeDistances   MutableBoundItemSel   SQ_weights   gb_flag_types3   
AW_option_menu_struct   EdgeFinder   MutableItemSelector   ST_base_vector   gb_header_flags   
AW_rgb16   EditedTerminal   MutationsPerSite   ST_Container   gb_header_list   
AW_rgb_diff   EG2PS_data   Mutex   ST_ML   gb_hierarchy_callback   
AW_rgb_normalized   EmblImporter   MySAXHandler   ST_rate_matrix   gb_hierarchy_callback_list   
AW_root   EmblParser   
  N  
Stack   gb_hierarchy_location   
AW_root_cblist   Emblref   StackFrameData   gb_if_entries   
AW_root_Motif   EmblSwissprotReader   NA_Alignment   StateStack   gb_index_files   
AW_scalar   EntryRemover   NA_Sequence   StaticCode (arb_test)   gb_Key   
AW_ScalerTransformer   Error   NamedCommand   StaticData   gb_local_data   
AW_screen_area   ErrorOr   NameInformation   StorableSelectionList   gb_map_header   
AW_selection   ExecutingMacro   Namelist   Store_species   gb_pending_callbacks   
AW_selection_list   EXP_item_type_species_selector   NameServerConnection   StrandPositionData   gb_quick_save   
AW_selection_list_entry   ExplicitQueryKey   NestingLevelKey   StrictlyAliased_BasePtrRef   gb_scandir   
AW_selection_list_iterator   ExplicitRange   NN_GlobalData   StrictlyTypedCallback   gb_server_data   
AW_simple_device   ExplicitReference   NoCaseCmp   StringParser   gb_transaction_save   
AW_size_tracker   ExportFieldScanner   Node   Struct2Dinfo   gb_triggered_callback   
AW_stylable   ExportFieldTracker   NodeInsertOrder   Struct2Dplus3D   gb_user   
AW_subset_selection   ExportFormatInfo (SEQIO)   NodeLeafDistance   Struct3Dinfo   gbb_Cluster   
AW_timer_cb_struct   Expression   NodeMarkers   Structure3D   gbb_data   
AW_toggle_field_struct   
  F  
NodeStack   StrUniquifier   gbb_freedata   
AW_trackPositions_device   NodeState   StrX   gbcmc_comm   
AW_trackSpecies_device   FailedAt   NodeTextBuilder   Subinfo   gbcms_create   
AW_var_target   FamilyFinder   Noncopyable   SuppressOutput   gbcms_delete_list   
AW_widget_refresh_cb   FamilyList   NoSuchCommand   SymmetricMatrixMapper   gbdata_offset   
AW_widget_value_pair   FamilyStat   Not   SymPart   gbdByKey   
AW_window   FastAlignInsertion   NoTuple   
  T  
gbl_param (GBL_IMPL)   
AW_window_menu   FastAlignReport   NSONS   gbm_data   
AW_window_menu_modes   FastSearchOccurrence   NT_global   Tab   gbm_pool   
AW_window_menu_modes_opengl   FastSearchSequence   NT_NODE   TaggedContentParser   gbm_table   
AW_window_message   Feature   NT_TreeShader   TargetGroup   gbs_hash_entry   
AW_window_Motif   FeatureLine   NtreeCommandLine   TargetItem   gbt_renamed   
AW_window_simple_menu   FieldReader   Nuc_Group (iupac)   Test   gc_desc   
AW_world   FieldSelDef   NullTracker   TextRef   gc_range   
AW_xfig   FieldTracker   
  O  
Texture2D   gde_database_access   
AW_xfig_line   File_selection   TimedCombines   gde_iteminfo   
AW_xfig_pos   FileContent   O_gbdByKey   TimeStamp   gene_container_changed_cb_data   
AW_xfig_text   FileWatch   Oligo   Token   gene_part_pos   
AW_zoomable   FileWriter   OligoRegistry   TokenList   gene_struct   
AWT_auto_refresh   FillStyle (AW)   OpenGLGraphics   TokenListBlock   gl_struct   
AWT_canvas   FilterDefinition   OptiPerfMeter   TokenMatcher   group_folding   
AWT_Codon_Code_Definition   FilteredExport   OrgInfo   TopologyShader   group_match (arb_test)   
AWT_command_data   FINAL_TYPE   Ostring   TrackedAwarChange   group_scaling   
AWT_config   FINAL_TYPE (arb_test)   OutgroupMatcher   TrackedFile   
  h  
AWT_config_definition   Flag   Output   TrackedFiles   
AWT_config_mapping_def   FlagLayout   OutputFormat   Translator   has_base_at   
AWT_configuration   FormatReader   
  P  
TransportedData (FieldTransfer)   has_been_deleted   
AWT_configuration_selection   FormattedFile   TransTables   has_id   
AWT_distance_meter   Formatter   Package   TraversalHitLimit   hash   
AWT_graphic   FormatTester   PaintData   TREE_canvas   hash_entry   
AWT_graphic_event   ForwardParamT   PaintedNode   TREE_canvas_registry   hasSequence   
AWT_graphic_exports   ForwardParamT< T * >   Pair   TREE_node_text_gen   hasType   
AWT_graphic_parsimony   ForwardParamT< void >   PairDefinition   TreeAwarRegistry   helix_pair_def   
AWT_graphic_tree   FoundGroup   PaperFormat   TreeInfo   helix_stack   
AWT_graphic_tree_group_state   FrameStack   Parameter   TreeNode   hits_sort_params   
AWT_nonDB_graphic   FullDictTree   Params   TreeOrderedSpecies   huffmann_list   
AWT_PDP   Function   ParentCache   TreePositionLookup   
  i  
AWT_predefined_config   Function< RT, P1, P2, void >   ParentGroupNameQueryKey   TreeReader   
AWT_registered_itemtype   Function< RT, P1, void, void >   PARS_commands   TreeRelativePosition   icilist   
AWT_scaled_font_limits   Function< RT, void, void, void >   ParsedProbeMatch   TreeRoot   import_format   
AWT_translator   FunInfo   Parser   TripleOffset   import_match   
AWT_tree_selection   
  G  
PARSIMONY_testenv   TSpecSet   indent   
  B  
PART   TwoLeafs   indexed_name   
GargChoice   PartialSequence   Type   initial_progress   
BackTraceInfo   GB_DbScanner   Partition   TypedAliData   initial_selfRef_progress   
Bakt_Info   GB_DICTIONARY   PartitionSize   TypedDatabaseCallback   inlist   
BaseCounter   GB_HASH   PartitionSpec   TypedSelectionList   is (arb_compile_assertion)   
BaseCounts   GB_initial_transaction   PartQueue   TypeMap   is< true > (arb_compile_assertion)   
BaseFrequencies   GB_INTern   PartRegistry   TypeOp   is_base_of (ARB_type_traits)   
BaseInverter   GB_INTern2   Paup   TypeOp< T & >   is_same (ARB_type_traits)   
BasePosition   GB_INTern_strings   PD_formatter   TypeOp< T const >   isAbove   
BasicStatus   GB_INTern_strings2   PerfTimer   TypeOp< void >   isBelow   
BestEdge   GB_MAIN_TYPE   PersistantFlag   TypeSwitch   island   
BI_ecoli_ref   GB_NUMHASH   PersistentNameServerConnection   TypeT   
  k  
BI_helix   GB_previousSecurityLevel   PH_display   
  U  
BI_helix_entry   GB_securityLevel   PH_display_status   keychar_table   
BitField   GB_shell   PH_filter   UniqueNameDetector   known_enum   
BitMask   GB_shell4perl   PH_NEIGHBOUR_DIST   UnitPair   
  l  
BitRange   GB_test_shell_closed   PH_NEIGHBOURJOINING   UnitPtr   
BitsBelowBit   GB_topSecurityLevel   PH_root   UnitTest_simple   less_DistinctPosRange   
BitsBelowBit< 31 >   GB_transaction   PH_used_windows   UnitTester   link_tree_data   
BitsBelowBit< 32 >   GBCONTAINER   Phaser   UseAnyTree   list_elem   
Bitvector   GBDATA   PHDATA   UsedColor   locinfo (arb_test)   
Block   GBENTRY   PlotParam   UserActionTracker   lt_field   
BootstrapConfig   GBENTRY_memory   PlugIn   UserFrame   lt_probe   
BoundActionTracker   GBL_call_env   PO_Less   UserlandCheck   ltByArbName   
BoundTreeAwarCallback   GBL_command_arguments   POS_TREE1   UseTreeRoot   ltByInternalName   
BoundWindowCallback   GBL_command_definition   POS_TREE2   
  V  
ltNonOverlap   
BranchLinewidthScaler   GBL_command_lookup_table   PosGene   
  m  
BranchMover   GBL_custom_command_lookup_table   Position (AW)   Validity   
BranchScaler   GBL_env   PositionPair   ValueCounter   mark_nontree_cb_data   
BranchWindow   GBL_maybe_itemless_call_env   PosRange   ValueTuple   match_expectation (arb_test)   
BufferedFileReader   GBL_simple_call_env   PrefixIterator   Vardesc   matchable (arb_test)   
BufferedPipeReader   GBL_streams   PrefixProbabilities   VarianceSampler   matcher (arb_test)   
BufferPtr   GBS_regex   PrimerDesign   VarUpdateInfo   merge_scheme   
  C  
GBS_string_matcher   PrintMaybe   Vector (AW)   mp_gl_struct   
GBS_strstruct   ProbeCandidates   Vector3   TreeNode::multifurc_limits   
Cache (cache)   GBT_config   ProbeCollDisplay   ViaFtsTransporter   
  n  
CacheEntry (cache)   GBT_config_item   ProbeCommonSettings   
  W  
CacheHandle (cache)   GBT_config_parser   ProbeIterator   name_value_pair   
Callback_FFV   GcgCommentWriter   ProbeMatch_impl   Warnings   nameOrder   
Callback_FVF   GcgWriter   ProbeMatchEventParam   WeightedFilter   nestable (ArbProgress)   
Callback_FVV   GEN_command_mode_param   ProbeMatchParser   Word   nestable   
Callback_VV   GEN_create_map_param   ProbeMatchSettings   WrapMode   no_counter   
CallbackData   GEN_extract_mode_param   ProbeOccurrence   Writer   node   
CallbackList   GEN_gene   ProbeValuation   WriteRule (FieldTransfer)   null_counter   
Candidate   GEN_graphic   ProgramError   
  X  
null_progress   
CanvasRef   GEN_item_type_species_selector   PromptData   numhash_entry   
CentigradePos   GEN_map_manager   Prototype   Xfig_Eater   
  o  
ChainEntryBuffer   GEN_map_window   PS_BitMap   XML_Comment   
ChainIteratorStage1   GEN_NodeTextBuilder   PS_BitSet   XML_Node   oligo_cmp_abs   
ChainIteratorStage2   GEN_position   PS_Callback   XML_Text   oligo_cmp_rel   
CharCounter   GEN_position_mem_handler   PS_Candidate   XMLFormatTarget   oligo_comparator   
CharPredicate   GEN_root   PS_FileBuffer   XString   olist   
CharPtrArray   GEN_unique_param   PS_Node   
  _  
output   
CharRangeTable   GEN_update_info   PS_Probe   
  p  
CheckedConsistencies   GenbankParser   PT_compressed   _fstruct   
ChecksumCollector   GenbankReader   PT_dump_loc   _GLwDrawingAreaClassPart   parameters   
ChildLookupTable   GenbankRef   PT_FamilyFinder   _GLwDrawingAreaClassRec   pfold_mem_handler   
CLI   GenebankImporter   PT_FF_comImpl   _GLwDrawingAreaRec   pngInfo   
ClickedElement   GenePositionMap   PT_long_chain_header   ChainIteratorStage1::_U::_L   pngRawInfo   
ClickedTarget   Generation   PT_selection   ChainIteratorStage1::_U::_S   predicate (arb_test)   
ClientActionTracker   GenerationDuplicates   PT_short_chain_header   _xfstruct   predicate_description (arb_test)   
Cluster   GetMatchesContext   PT_statistic   
  a  
predicate_matcher (arb_test)   
Clusterer   GfileFormat   PT_Traversal   preserve_para   
ClustersData   Globals   PTserverConnection   acceptAnyTerminal   prettyopts   
Code   GlobalStringBuffers   
  Q  
acceptConsensusTerminal   probe   
Codon_Group   GLRenderer   adfiltercbstruct   probe_combi_statistic   
ColorGroupDef   GLwDrawingAreaCallbackStruct   QuadraticThreshold   aisc_bytes_list   probe_input_data   
ColorMap   GLwDrawingAreaPart   QueriedGroups   aisc_com   probe_statistic_struct   
ColorRGBf   Gmenu   QueryExpr   aisc_hash_node   probe_struct_global   
Column   GmenuItem   QueryKey   aisc_static_set_mem   probe_tabs   
ColumnQualityInfo   GmenuItemArg   QueryTarget   ali_aligner_cell   promotion   
ColumnStat   Group   
  R  
ali_aligner_column   pt_global   
ColumnWidths   GroupAIDkey   ali_aligner_dellist   ptnd_chain_count_mishits   
CombinableSeq   GroupBuilder   RandomNumberGenerator   ali_aligner_dellist_elem   
  q  
CombinedPosInfo   GroupChanges   Range   ali_aligner_last_cell   
Command   GroupCluster   RangeList   ali_aligner_result   query_spec (QUERY)   
CommandOutput   GroupFoldedKey   RatioLimits   ali_aligner_tripel   queued_line   
CommentSkippingFileBuffer   GroupInfo   RB_INFO   ali_family_member   
  r  
CompactedSequence   GroupIterator   RDP_comments   ali_pathmap_up_pointer   
CompactedSubSequence   GroupKeeledKey   ReadableDataLoc   ali_prealigner_approx_element   remote_awars   
CompareAlpha   GroupMarkedKey   Reader   ali_prealigner_approximation   remove_const (ARB_type_traits)   
A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Z | _