ARB
Class Index
A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Z | _
  A  
Complement   GroupRename_callenv   Realigner   alist   
ComplementLocation   GroupSearch   RecalcNeeded   apd_sequence   
AbsLoc   CompountT   GroupSearchCommon   RecordingMacro   arb_handlers   
ACI_Labeler   CompountT< R()>   GroupSizeKey   Rectangle (AW)   arb_params   
AdaptedAlignmentTransporter   CompountT< R(P1)>   GroupUIdata   RefContainer   arb_prm_struct   
AISC_Object   CompountT< R(P1,...)>   GroupXfer_callenv   Reference   arb_progress   
ALI_ALIGNER   CompountT< T & >   GroupZombiesKey   References   arb_r2a_pro_2_nuc   
ALI_ALIGNER_CONTEXT   CompountT< T * >   
  H  
ReferringEntriesHandler (RefEntries)   arb_r2a_pro_2_nucs   
ALI_ARBDB   CompountT< T C::* >   RefPtr   arb_status_implementation   
ALI_GLOBAL   CompountT< T[]>   HasLevelSmallerThan   Refs   arb_suppress_progress   
ALI_MAP   CompountT< T[N]>   HasntCurrentClusterPrefix   RefSelector (RefEntries)   asserter (arb_test)   
ALI_NORM_SEQUENCE   CompressionRoot   Header   RegExpr   auto_delete_array_ptr   
ALI_PATHMAP   ConfigDefinition   HeaderList   RegFieldSelection   auto_delete_ptr   
ALI_PREALIGNER   ConfigDeleter   HelixNrInfo   RegMatch   auto_free_ptr   
ALI_PREALIGNER_CONTEXT   ConfigMapping   Helpfile   RequiresActionTracker   aw_stg_struct   
ALI_PROFILE   ConfigModifier   Hit   ResourceStack   aw_toggle_data   
ALI_PROFILE_CONTEXT   ConfigRenamer   HitCounter   RNA3D_Global   aw_xargs   
ALI_PT   Consensus   Host (ARB_type_traits)   RNA3D_Graphics   awar_vars   
ALI_PT_CONTEXT   ConsensusBuildParams   Hs_struct   RootAsWindowCallback   awModDef   
ALI_selection   ConsensusReference   
  I  
RootSynchronizer   awt_assignment   
ALI_sellst_spec   ConsensusTree   RSpecSet   awt_check_box   
ALI_SEQUENCE   ConsensusTreeBuilder   ID_checker   Rule (FieldTransfer)   awt_hotkeys   
ALI_SUB_SOLUTION   ConstParamT   IfThenElseType   RulerScaler   awt_input_field   
ALI_TARRAY   ConstParamT< T * >   IfThenElseType< false, T, F >   RuleSet (FieldTransfer)   awt_input_handler   
ALI_TLIST   ConstParamT< void >   IfThenElseType< true, T, F >   
  S  
awt_input_mask_global   
ALI_TLIST_ELEM   ConstStrArray   Importer   awt_input_mask_id_list   
ALI_TSTACK   ConsumeUDC   ImportFieldScanner   S_cfgLine   awt_item_type_selector   
AliAdmin   ConsumeUDC< T, false >   ImportSession   S_Frand   awt_linked_to_item   
AliApplicable   ConsumeUDC< void, convert_possible >   ImportTestData   S_RNS   awt_mask_action   
AliAutoFormatCommand   Convaln_exception   InfoWindow   S_Spreading   awt_mask_awar_item   
AliChange   ConvertibleData   InfoWindowRegistry   SAI_graphic   awt_mask_item   
AliCompositeCommand   Counted   InputFileError   SAI_selection   awt_numeric_input_field   
AliData   CurrSpecies   InputFormat   SAI_sellst_spec   awt_radio_button   
AliDataSlice   CursorPos   InsertData   SAI_string_builder   awt_string_handler   
AliDeleteCommand   
  D  
Insertions   SaiAciApplicator   awt_text_viewport   
AliEditCommand   InsertPerfMeter   SaiBoolchainOperator   awt_variable   
AliEditor   Data   Int   SaiBoolRule   awt_viewport   
AliEntryCounter   DataLoc   Interpreter   SaiCalcEnv   awXKeymap   
AlignBuffer   DB_scalable   IRS_data   SaiCalculator   awXKeymap_modfree   
AlignDataAccess   DBerror   IsCallback   SaiOperator   
  b  
Aligner   DBID   IsClassT   Sampler   
Alignment   DbQuery (QUERY)   IsEnumT   Scaler   binop_pair   
AlignmentReference   DbScanner   IsFunctionT   ScopedTransporter   bitcounter   
AlignmentTransporter (FieldTransfer)   DBwriter   IsFundaT   SCP_Less   bytestring   
AlignParams   DecisionTree   IsSpecificCallback   ScrollSynchronizer   
  c  
AliInsertCommand   DeconstructedTree   IsSpecificHierarchyCallback   SearchAwarList   
AliNameAndType   DefinedCommands   Item   SearchedTree   cached_taxonomy   
AliView   DelayReshade   ItemClonedByRuleSet (FieldTransfer)   SearchFIFO   case_op   
Ambiguity (chartable)   Deletable   Itemfield_Selection   SearchParameter   PT_statistic::chain_head_mem   
AN_gl_struct   DendroSubtreeLimits   ItemFieldShader   SearchRelativeParams   charpLess   
Angle (AW)   DepthMarker   ItemShader   SearchRelativesReference   cilist   
AngleBuffer   Desco (validNames)   
  J  
SearchSettings   client_msg_queue   
AP_combinableSeq   DesignTargets   SearchTree   cllist   
AP_DefaultTreeShader   DI_ENTRY   JoinedLocation   SearchTreeNode   cmp_candidates   
AP_filter   DI_GLOBAL_MATRIX   
  K  
SEC_base   cmp_Rectangles   
AP_main   DI_MATRIX   SEC_base_iterator   color_save_data   
AP_matrix   Dict   Keeper   SEC_base_part   column   
AP_pos_var   DictData   KeyInfo   SEC_base_part_iterator   common_filter_params   
AP_rates   DictTree   KeySorter   SEC_bond_def   comparator   
AP_sequence   DiffLines   KL_params   SEC_constrainted   compare_by_criteria   
AP_sequence_simple_protein   DisplayFormat   KL_Settings   SEC_db_interface   complex   
AP_smatrix   DistanceCounter   
  L  
SEC_dbcb   consensus_result   
AP_STACK   Distributor   SEC_displayParams   containing (arb_test)   
AP_subtree   DNA_Table   Label   SEC_drawn_positions   copy (arb_test)   
AP_tree   DontTransportAlignment   Lazy   SEC_oriented   copy< const char * > (arb_test)   
AP_tree_edge   Dots   LazyAliData   SEC_region   copy< copy< T > > (arb_test)   
AP_tree_folding   Dragged   LazyFloat   SEC_root   count_mutpsite   
AP_tree_members   DragNDrop   LazyPersistantFlag   SEC_segment_iterator   count_nothing   
AP_tree_root   DupCriteria   LeafRelation   SEC_seq_data   count_unweighted   
AP_TreeShader   DuplicateLinkFilter   TreeNode::LengthCollector   SEC_strand_const_iterator   count_weighted   
AP_userdef_matrix   DupNameCriterion   LikelihoodRanges   SEC_strand_iterator   counter   
AP_weights   
  E  
LimitedTime   SEC_structure_toggler   counter (ArbProgress)   
ARB_countedTree   LimitTracker   SelectedDatabase   cursorpos   
ARB_edge   ED4_abstract_group_manager   LineAttachedMessage   SelectionListSpec   custom_dealloc_ptr   
ARB_ERROR   ED4_abstract_sequence_terminal   LineBuf   SepBaseFreq (chartable)   customCriterion   
ARB_inc_sleep   ED4_area_manager   LinePart   Seq   
  d  
ARB_init_perl_interface   ED4_base   LineQueue   SeqInfo   
ARB_seqtree   ED4_base_position   LineReader   SeqPart   db_interrupt_data   
ARB_seqtree_root   ED4_block   LineVector (AW)   Sequence   debug_asserter (arb_test)   
ARB_TIME   ED4_block_operator   Link   SequenceAliData   dereference   
ARB_timeout   ED4_bracket_terminal   List   SequenceBuffer   dereference< T * >   
ARB_timestamp   ED4_cb_list   ListDisplayRow   SequenceHandler   dereference< T *const >   
ARB_tree_info   ED4_consensus_sequence_terminal   LoadSaveSearchParam   SequenceIterator   di_protdist   
ARB_tree_predicate   ED4_container   LocallyModify   SequencePosition   diff_params   
ArbCachedString   ED4_coords   Location   SetOnce   different_types   
ARBDB_memory_manager   ED4_cursor   LocationEditor   Setup (iupac)   difflineMode   
ArbDBWriter   ED4_CursorShape   LongBranchMarker   SetVariables   disallow_type   
ArbImporter   ED4_device_manager   LooseBases   ShaderPlugin   dot_insert_stat   
ArbMatchResult   ED4_dragNdrop_info   LowDataCheck   ShallBeDeleted   double_xfer   
ArbMatchResultsManager   ED4_Edit_String   
  M  
ShowHelix_cd   doublecomplex   
ArbParsimony   ED4_extension   SimpleFormatReader   drawdata   
ArbPC_Context   ED4_foldable   MackeParser   SimpleLocation   dt_bondssum   
ArbPM_Context   ED4_folding_line   MackeReader   SimpleRoot   
  e  
ArbProbe   ED4_group_manager   MacroRecorder   SimpleTester   
ArbProbeCollection   ED4_highlighted_entry   MacroTalkSleep   SingleDictTree   ed_key   
ArbProbeMatchWeighting   ED4_host   MarkedPrefixes   SizeAwarable   epsilon_similar (arb_test)   
ArbRefCount   ED4_line_terminal   MarkerDisplay   SizeAwareRoot   equals   
ArbStringCache   ED4_list   MarkerIdentifier   SizedBufferPtr   expectation (arb_test)   
ArbTcpDat   ED4_list_elem   MarkerPosition   SizedCstr   expectation_group (arb_test)   
ArbWriteFile_Context   ED4_LocalWinContext   MarkerXPos   SizeOverOne   export_environment   
ArgParser   ED4_manager   MaskCommandDefinition   SlaveCanvas   export_format   
AttributeParser   ED4_MostRecentWinContext   MasterCanvas   SlaveCanvas_internal   export_sequence_data   
AutoMatchSettings   ED4_move_info   MasterSequence   SmartPtr   
  f  
AvailableFieldScanner   ED4_multi_name_manager   MatchingOligo   Smoother   
AW_area_management   ED4_multi_sequence_manager   MatchRequest   Socinf   fallbacks   
AW_at   ED4_multi_species_manager   MatrixDisplay   Sonde   filter_params   
AW_at_auto   ED4_name_manager   MatrixOrder   Sondentopf   for_data   
AW_at_maxsize   ED4_objspec   MaxBond   SortByTopo   format_props   
AW_at_size   ED4_objspec_registry   MemBlock   SortClusterIDsBy   formatTable   
AW_at_storage   ED4_orf_terminal   MemBlockManager   SortedFreq   fragment   
AW_awar   ED4_plugin_host   MemDump   Spec (TreeAdmin)   
  g  
AW_buttons_struct   ED4_reference   Memory   SpeciesConcatenateList   
AW_cb   ED4_reference_terminals   MergeFieldScanner   SpeciesFlag   g_b_undo_entry   
AW_CL_castableType   ED4_remap   MessageAttachable   SpeciesFlags   g_b_undo_gbd   
AW_click_cd   ED4_root   MessageSpamFilter   SpeciesInTwoTrees   g_b_undo_header   
AW_clicked_box   ED4_root_group_manager   MetaInfo   SpeciesMergeList   g_b_undo_list   
AW_clicked_element   ED4_scroll_links   MetaTag   SpeciesSelector   g_b_undo_mgr   
AW_clicked_line   ED4_scroll_picture   MetaTagTranslator   SpeciesSpace   gb_buffer   
AW_clicked_text   ED4_scrolled_rectangle   MG_remap   SpecificAliData   gb_cache   
AW_clip_scale_stack   ED4_SearchPosition   MG_remaps   SpecificGap   gb_cache_entry   
AW_clipable   ED4_SearchResults   Mismatches   SpecSet   gb_callback   
AW_common   ED4_seq_colors   MismatchWeights   SpecSetRegistry   gb_callback_list   
AW_common_Xm   ED4_sequence_manager   MITuple   Splits   gb_compress_list   
AW_DB_selection   ED4_sequence_terminal   MO_Liste   Spoolable   gb_compress_tree   
AW_device   ED4_species_pointer   MO_Mismatch   SpoolableColor   gb_data_base_type_union   
AW_device_size   ED4_terminal   ModRLimit   SpoolableString   gb_data_base_type_union2   
AW_event   ED4_TerminalPredicate   MostLikelySeq   SPOOLER   gb_data_list   
AW_font_group   ED4_text_terminal   MostUsedPos   SQ_ambiguities   gb_db_extended   
AW_font_limits   ED4_update_info   MP_list_elem   SQ_GroupData   gb_exitfun   
AW_font_overlap   ED4_WinContext   MP_Main   SQ_GroupData_Impl   gb_extern_data   
AW_GC   ED4_WinContextFree   MP_Window   SQ_GroupData_PRO   gb_extern_data2   
AW_GC_config   ED4_window   MultiFastaWriter   SQ_GroupData_RNA   gb_flag_types   
AW_gc_manager   ED4_work_info   MultiFieldReader   SQ_helix   gb_flag_types2   
AW_GC_set   EdgeBetween   Multiroot   SQ_physical_layout   gb_flag_types3   
AW_GC_Xm   EdgeChain   Multitype   SQ_weights   gb_header_flags   
AW_helix   EdgeDistances   MutableBoundItemSel   ST_base_vector   gb_header_list   
AW_hsv   EdgeFinder   MutableItemSelector   ST_Container   gb_hierarchy_callback   
AW_option_menu_struct   EditedTerminal   MutationsPerSite   ST_ML   gb_hierarchy_callback_list   
AW_rgb16   EG2PS_data   Mutex   ST_rate_matrix   gb_hierarchy_location   
AW_rgb_diff   EmblImporter   
  N  
Stack   gb_if_entries   
AW_rgb_normalized   EmblParser   StackFrameData   gb_index_files   
AW_root   Emblref   NA_Alignment   StateStack   gb_Key   
AW_root_cblist   EmblSwissprotReader   NA_Sequence   StaticCode (arb_test)   gb_local_data   
AW_root_Motif   EntryRemover   NamedCommand   StaticData   gb_map_header   
AW_scalar   Error   NameInformation   StorableSelectionList   gb_pending_callbacks   
AW_ScalerTransformer   ErrorOr   Namelist   Store_species   gb_quick_save   
AW_screen_area   ExecutingMacro   NameServerConnection   StrandPositionData   gb_scandir   
AW_selection   EXP_item_type_species_selector   NestingLevelKey   StrictlyAliased_BasePtrRef   gb_server_data   
AW_selection_list   ExplicitQueryKey   NN_GlobalData   StrictlyTypedCallback   gb_transaction_save   
AW_selection_list_entry   ExplicitRange   NoCaseCmp   StringParser   gb_triggered_callback   
AW_selection_list_iterator   ExplicitReference   Node   Struct2Dinfo   gb_user   
AW_simple_device   ExportFieldScanner   Node_ID_Labeler   Struct2Dplus3D   gbb_Cluster   
AW_size_tracker   ExportFieldTracker   NodeInsertOrder   Struct3Dinfo   gbb_data   
AW_stylable   ExportFormatInfo (SEQIO)   NodeLeafDistance   Structure3D   gbb_freedata   
AW_subset_selection   Expression   NodeMarkers   StrUniquifier   gbcmc_comm   
AW_timer_cb_struct   
  F  
NodeStack   Subinfo   gbcms_create   
AW_toggle_field_struct   NodeState   SuppressOutput   gbcms_delete_list   
AW_trackPositions_device   FailedAt   NodeTextBuilder   SymmetricMatrixMapper   gbdata_offset   
AW_trackSpecies_device   FamilyFinder   Noncopyable   SymPart   gbdByKey   
AW_var_target   FamilyList   NoSuchCommand   
  T  
gbl_param (GBL_IMPL)   
AW_widget_refresh_cb   FamilyStat   Not   gbm_data   
AW_widget_value_pair   FastAlignInsertion   NoTuple   Tab   gbm_pool   
AW_window   FastAlignReport   NSONS   TaggedContentParser   gbm_table   
AW_window_menu   FastSearchOccurrence   NT_global   TargetGroup   gbs_hash_entry   
AW_window_menu_modes   FastSearchSequence   NT_NODE   TargetItem   gbt_renamed   
AW_window_menu_modes_opengl   Feature   NT_TreeShader   Test   gc_desc   
AW_window_message   FeatureLine   NtreeCommandLine   TextRef   gc_range   
AW_window_Motif   FieldReader   Nuc_Group (iupac)   TimedCombines   gde_database_access   
AW_window_simple_menu   FieldSelDef   NullTracker   TimeStamp   gde_iteminfo   
AW_world   FieldTracker   
  O  
Token   gene_container_changed_cb_data   
AW_xfig   File_selection   TokenList   gene_part_pos   
AW_xfig_line   FileContent   O_gbdByKey   TokenListBlock   gene_struct   
AW_xfig_pos   FileWatch   Oligo   TokenMatcher   gl_struct   
AW_xfig_text   FileWriter   OligoRegistry   TopologyShader   group_folding   
AW_zoomable   FillStyle (AW)   OptiPerfMeter   TrackedAwarChange   group_match (arb_test)   
AWT_auto_refresh   FilterDefinition   OrgInfo   TrackedFile   group_scaling   
AWT_canvas   FilteredExport   Ostring   TrackedFiles   
  h  
AWT_Codon_Code_Definition   FINAL_TYPE   OutgroupMatcher   Translator   
AWT_command_data   FINAL_TYPE (arb_test)   Output   TransportedData (FieldTransfer)   has_base_at   
AWT_config   Flag   OutputFormat   TransTables   has_been_deleted   
AWT_config_definition   FlagLayout   
  P  
TraversalHitLimit   has_id   
AWT_config_mapping_def   FormatReader   TREE_canvas   hash   
AWT_configuration   FormattedFile   Package   TREE_canvas_registry   hash_entry   
AWT_configuration_selection   Formatter   PaintData   TreeAwarRegistry   hasSequence   
AWT_distance_meter   FormatTester   PaintedNode   TreeContainer   hasType   
AWT_graphic   ForwardParamT   Pair   TreeInfo   helix_pair_def   
AWT_graphic_event   ForwardParamT< T * >   PairDefinition   TreeLabeler   helix_stack   
AWT_graphic_exports   ForwardParamT< void >   PaperFormat   TreeNode   hits_sort_params   
AWT_graphic_parsimony   FoundGroup   Parameter   TreeOrderedSpecies   huffmann_list   
AWT_graphic_tree   FrameStack   Params   TreeParts   
  i  
AWT_graphic_tree_group_state   FullDictTree   ParentCache   TreePositionLookup   
AWT_nonDB_graphic   Function   ParentGroupNameQueryKey   TreeReader   icilist   
AWT_PDP   Function< RT, P1, P2, void >   PARS_commands   TreeRelativePosition   import_format   
AWT_predefined_config   Function< RT, P1, void, void >   ParsedProbeMatch   TreeRoot   import_match   
AWT_registered_itemtype   Function< RT, void, void, void >   Parser   TripleOffset   indent   
AWT_scaled_font_limits   FunInfo   PARSIMONY_testenv   TSpecSet   indexed_name   
AWT_translator   
  G  
PART   TwoLeafs   initial_progress   
AWT_tree_selection   PartialSequence   Type   initial_selfRef_progress   
  B  
GargChoice   Partition   TypedAliData   inlist   
GB_DbScanner   PartitionSize   TypedDatabaseCallback   is (arb_compile_assertion)   
BackTraceInfo   GB_DICTIONARY   PartitionSpec   TypedSelectionList   is< true > (arb_compile_assertion)   
Bakt_Info   GB_HASH   PartQueue   TypeMap   is_base_of (ARB_type_traits)   
BaseCounter   GB_initial_transaction   PartRegistry   TypeOp   is_same (ARB_type_traits)   
BaseCounts   GB_INTern   Paup   TypeOp< T & >   isAbove   
BaseFrequencies   GB_INTern2   PD_formatter   TypeOp< T const >   isBelow   
BaseInverter   GB_INTern_strings   PerfTimer   TypeOp< void >   island   
BasePosition   GB_INTern_strings2   PersistantFlag   TypeSwitch   
  k  
BasicStatus   GB_MAIN_TYPE   PersistentNameServerConnection   TypeT   
BestEdge   GB_NUMHASH   PH_display   
  U  
keychar_table   
BI_ecoli_ref   GB_previousSecurityLevel   PH_display_status   known_enum   
BI_helix   GB_securityLevel   PH_filter   UniqueNameDetector   
  l  
BI_helix_entry   GB_shell   PH_NEIGHBOUR_DIST   UnitPair   
BitField   GB_shell4perl   PH_NEIGHBOURJOINING   UnitPtr   less_DistinctPosRange   
BitMask   GB_test_shell_closed   PH_root   UnitTest_simple   link_tree_data   
BitRange   GB_topSecurityLevel   PH_used_windows   UnitTester   list_elem   
BitsBelowBit   GB_transaction   Phaser   UseAnyTree   locinfo (arb_test)   
BitsBelowBit< 31 >   GBCONTAINER   PHDATA   UsedColor   lt_field   
BitsBelowBit< 32 >   GBDATA   PlotParam   UserActionTracker   lt_probe   
Bitvector   GBENTRY   PlugIn   UserFrame   ltByArbName   
Block   GBENTRY_memory   PO_Less   UserlandCheck   ltByInternalName   
BootstrapConfig   GBL_call_env   POS_TREE1   UseTreeRoot   ltNonOverlap   
BoundActionTracker   GBL_command_arguments   POS_TREE2   
  V  
  m  
BoundTreeAwarCallback   GBL_command_definition   PosGene   
BoundWindowCallback   GBL_command_lookup_table   Position (AW)   Validity   mark_nontree_cb_data   
BranchLinewidthScaler   GBL_custom_command_lookup_table   PositionPair   ValueCounter   match_expectation (arb_test)   
BranchMover   GBL_env   PosRange   ValueTuple   matchable (arb_test)   
BranchScaler   GBL_maybe_itemless_call_env   PrefixIterator   Vardesc   matcher (arb_test)   
BranchWindow   GBL_simple_call_env   PrefixProbabilities   VarianceSampler   merge_scheme   
BufferedFileReader   GBL_streams   PrimerDesign   VarUpdateInfo   mp_gl_struct   
BufferedPipeReader   GBS_regex   PrintMaybe   Vector (AW)   TreeNode::multifurc_limits   
BufferPtr   GBS_string_matcher   ProbeCandidates   Vector3   
  n  
  C  
GBS_strstruct   ProbeCollDisplay   ViaFtsTransporter   
GBT_config   ProbeCommonSettings   
  W  
name_value_pair   
Cache (cache)   GBT_config_item   ProbeIterator   nameOrder   
CacheEntry (cache)   GBT_config_parser   ProbeMatch_impl   Warnings   nestable   
CacheHandle (cache)   GcgCommentWriter   ProbeMatchEventParam   WeightedFilter   nestable (ArbProgress)   
Callback_FFV   GcgWriter   ProbeMatchParser   Word   no_counter   
Callback_FVF   GEN_command_mode_param   ProbeMatchSettings   WrapMode   node   
Callback_FVV   GEN_create_map_param   ProbeOccurrence   Writer   null_counter   
Callback_VV   GEN_extract_mode_param   ProbeValuation   WriteRule (FieldTransfer)   null_progress   
CallbackData   GEN_gene   ProgramError   
  X  
numhash_entry   
CallbackList   GEN_graphic   PromptData   
  o  
Candidate   GEN_item_type_species_selector   Prototype   Xfig_Eater   
CanvasRef   GEN_map_manager   PS_BitMap   XML_Comment   oligo_cmp_abs   
CentigradePos   GEN_map_window   PS_BitSet   XML_Node   oligo_cmp_rel   
ChainEntryBuffer   GEN_NodeTextBuilder   PS_Callback   XML_Text   oligo_comparator   
ChainIteratorStage1   GEN_position   PS_Candidate   XString   olist   
ChainIteratorStage2   GEN_position_mem_handler   PS_FileBuffer   
  _  
output   
CharCounter   GEN_root   PS_Node   
  p  
CharPredicate   GEN_unique_param   PS_Probe   _fstruct   
CharPtrArray   GEN_update_info   PT_compressed   _GLwDrawingAreaClassPart   parameters   
CharRangeTable   GenbankParser   PT_dump_loc   _GLwDrawingAreaClassRec   pfold_mem_handler   
CheckedConsistencies   GenbankReader   PT_FamilyFinder   _GLwDrawingAreaRec   pngInfo   
ChecksumCollector   GenbankRef   PT_FF_comImpl   ChainIteratorStage1::_U::_L   pngRawInfo   
ChildLookupTable   GenebankImporter   PT_long_chain_header   ChainIteratorStage1::_U::_S   predicate (arb_test)   
CLI   GenePositionMap   PT_selection   _xfstruct   predicate_description (arb_test)   
ClickedElement   Generation   PT_short_chain_header   
  a  
predicate_matcher (arb_test)   
ClickedTarget   GenerationDuplicates   PT_statistic   preserve_para   
ClientActionTracker   GetMatchesContext   PT_Traversal   acceptAnyTerminal   prettyopts   
Cluster   GfileFormat   PTserverConnection   acceptConsensusTerminal   probe   
Clusterer   Globals   
  Q  
adfiltercbstruct   probe_combi_statistic   
ClustersData   GlobalStringBuffers   aisc_bytes_list   probe_input_data   
Code   GLwDrawingAreaCallbackStruct   QuadraticThreshold   aisc_com   probe_statistic_struct   
Codon_Group   GLwDrawingAreaPart   QueriedGroups   aisc_hash_node   probe_struct_global   
ColorGroupDef   Gmenu   QueryExpr   aisc_static_set_mem   probe_tabs   
ColorMap   GmenuItem   QueryKey   ali_aligner_cell   promotion   
ColorRGBf   GmenuItemArg   QueryTarget   ali_aligner_column   pt_global   
Column   Group   
  R  
ali_aligner_dellist   ptnd_chain_count_mishits   
ColumnQualityInfo   GroupAIDkey   ali_aligner_dellist_elem   
  q  
ColumnStat   GroupBuilder   RandomNumberGenerator   ali_aligner_last_cell   
ColumnWidths   GroupChanges   Range   ali_aligner_result   query_spec (QUERY)   
CombinableSeq   GroupCluster   RangeList   ali_aligner_tripel   queued_line   
CombinedPosInfo   GroupFoldedKey   RatioLimits   ali_family_member   
  r  
Command   GroupInfo   RB_INFO   ali_pathmap_up_pointer   
CommandOutput   GroupIterator   RDP_comments   ali_prealigner_approx_element   remote_awars   
CommentSkippingFileBuffer   GroupKeeledKey   ReadableDataLoc   ali_prealigner_approximation   remove_const (ARB_type_traits)   
CompactedSequence   GroupMarkedKey   Reader   ali_prealigner_cell   remove_const< const T > (ARB_type_traits)   
CompactedSubSequence   GroupMatchScorer   ReadRule (FieldTransfer)   ali_prealigner_column   remove_cv (ARB_type_traits)   
CompareAlpha   GroupNameQueryKey   ReadSeqVars   ali_prealigner_mask   remove_volatile (ARB_type_traits)   
CompareByLength   GroupPenalty   RealignAttempt   ali_pt_member   remove_volatile< volatile T > (ARB_type_traits)   
A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Z | _