- g -
- g_b_add_size_to_undo_entry()
: adindex.cxx
- g_b_check_undo_size()
: adindex.cxx
- g_b_check_undo_size2()
: adindex.cxx
- g_b_Consensus_add()
: adseqcompr.cxx
- g_b_Consensus_get_sequence()
: adseqcompr.cxx
- g_b_count_leafs()
: adseqcompr.cxx
- g_b_create_master()
: adseqcompr.cxx
- g_b_delete_Consensus()
: adseqcompr.cxx
- g_b_new_Consensus()
: adseqcompr.cxx
- g_b_opti_createGbdByKey()
: adoptimize.cxx
- g_b_opti_freeGbdByKey()
: adoptimize.cxx
- g_b_opti_scanGbdByKey()
: adoptimize.cxx
- g_b_put_number2()
: adseqcompr.cxx
- g_b_put_sequences_in_container()
: adseqcompr.cxx
- g_b_read_number2()
: adseqcompr.cxx
- g_b_read_undo_key_pntr()
: adindex.cxx
- g_b_uncompress_single_sequence_by_master()
: adseqcompr.cxx
- g_b_undo()
: adindex.cxx
- g_b_undo_info()
: adindex.cxx
- g_b_write_run()
: adcompr.cxx
- g_bcms_delete_Socinf()
: adcomm.cxx
- g_bs_add_value_tag_to_hash()
: adstring.cxx
- g_bs_convert_string_to_tagged_hash_with_delete()
: adstring.cxx
- g_bs_convert_string_to_tagged_hash_with_rewrite()
: adstring.cxx
- g_bs_free_hash_of_hashes()
: adstring.cxx
- g_bs_free_hash_of_hashes_elem()
: adstring.cxx
- g_bs_get_string_of_tag_hash()
: adstring.cxx
- g_bs_merge_tags()
: adstring.cxx
- g_bs_read_final_hash()
: adstring.cxx
- g_bs_read_tagged_hash()
: adstring.cxx
- gb_abort_and_close_all_DBs()
: gb_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_abort_entry()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_abort_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_abort_transaction_local_rek()
: ad_core.cxx
, gb_data.h
, gb_prot.h
- gb_abortdata()
: ad_core.cxx
- gb_add_callback()
: ad_cb.cxx
- GB_add_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- GB_add_hierarchy_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- gb_add_ref_gb_transaction_save()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_add_reference()
: ad_save_load.cxx
- gb_alloc_cache_index()
: adcache.cxx
, gb_prot.h
- GB_allow_compression()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_append_exportedError()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_append_suffix()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_arbtcpdat_path()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- GB_ARRAY_FLAGS()
: gb_header.h
- gb_ascii_2_bin()
: ad_save_load.cxx
, gb_prot.h
- GB_atclose_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- GB_atexit()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_atof()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_await_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_begin_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_bin_2_ascii()
: ad_save_load.cxx
- GB_brother()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- gb_build_compress_list()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_build_uncompress_tree()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_cache_genome()
: adali.cxx
- GB_calc_structure_size()
: ad_prot.h
- GB_canonical_path()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_change_my_security()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_check_hkey()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- gb_check_huffmann_tree()
: adcompr.cxx
- gb_check_in_undo_create()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- gb_check_in_undo_delete()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- gb_check_in_undo_modify()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- GB_check_key()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GB_check_out_buffer()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_checksum()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GB_child()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_clear_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_clear_macro_error()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GB_clear_temporary()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_clear_user_flag()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_clone()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_clone_explicit()
: arbdb.cxx
- GB_close()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_command_interpreter()
: ad_prot.h
, gb_aci.cxx
- GB_command_interpreter_in_env()
: ad_prot.h
, gb_aci.cxx
- GB_commit_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_commit_transaction_local_rek()
: ad_core.cxx
, gb_data.h
, gb_prot.h
- gb_compare_function__2__sellist_cmp_fun()
: AW_select.cxx
- gb_compress_bits()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_compress_by_dictionary()
: gb_prot.h
, adoptimize.cxx
- gb_compress_data()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_compress_equal_bytes()
: adcompr.cxx
- gb_compress_equal_bytes_2()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_compress_huffmann()
: adcompr.cxx
- gb_compress_huffmann_add_to_list()
: adcompr.cxx
- gb_compress_huffmann_pop()
: adcompr.cxx
- gb_compress_huffmann_rek()
: adcompr.cxx
- gb_compress_longs()
: adcompr.cxx
- gb_compress_seq_by_master()
: adseqcompr.cxx
- gb_compress_sequence_by_master()
: adseqcompr.cxx
- GB_concat_full_path()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_concat_path()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_concat_path_in_ARBHOME()
: adsocket.cxx
- GB_concat_path_in_ARBLIB()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- gb_convert_compression()
: adoptimize.cxx
- gb_convert_V2_to_V3()
: adoptimize.cxx
, gb_prot.h
- gb_copy_checked()
: arbdb.cxx
- GB_copy_dropMarksAndTempstate()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_copy_dropProtectMarksAndTempstate()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_copy_explicit()
: arbdb.cxx
- GB_copy_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_copy_full()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_copy_overlay()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_copy_std()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_countEntries()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_create()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_create()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- gb_create_container()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_create_container()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_create_dict()
: adsystem.cxx
- gb_create_dictionaries()
: adoptimize.cxx
- gb_create_dictionary()
: adoptimize.cxx
- GB_create_directory()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_create_header_array()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_create_index()
: ad_prot.h
, adindex.cxx
- gb_create_key()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_create_key_array()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_create_parent_directory()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_create_reference()
: ad_save_load.cxx
- GB_create_tempfile()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_DATA_LIST_HEADER()
: gb_data.h
- gb_del_ref_and_extern_gb_transaction_save()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_del_ref_gb_transaction_save()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_delete()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_delete_database()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_delete_dummy_father()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_delete_entry()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_delete_force()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- gb_delete_main_entry()
: ad_core.cxx
- gb_delete_reference()
: ad_save_load.cxx
- gb_destroy_indices()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- GB_disable_path()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_disable_quicksave()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_disable_undo()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- gb_do_callbacks()
: arbdb.cxx
- GB_dump()
: ad_prot.h
, adTest.cxx
- GB_dump_db_path()
: ad_prot.h
, adTest.cxx
- GB_dump_indices()
: ad_prot.h
- GB_dump_no_limit()
: ad_prot.h
, adTest.cxx
- GB_end_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
, arbdb.h
- GB_end_transaction_show_error()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
, arbdb.h
- GB_ensure_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- GB_entry()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_existing_file()
: adfile.cxx
- GB_exit_gb()
: arbdb.cxx
- gb_expect_type()
: adquery.cxx
- GB_export_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_export_errorf()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_export_IO_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_failedTo_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_FATHER()
: gb_data.h
- GB_find()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_find_all_files()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- gb_find_by_nr()
: adquery.cxx
, gb_prot.h
- GB_find_executable()
: adsocket.cxx
- GB_find_existing_quark()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_find_int()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- gb_find_internal()
: adquery.cxx
- GB_find_latest_file()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- gb_find_or_create_NULL_quark()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_find_or_create_quark()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_find_or_create_quark()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_find_string()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_find_sub_by_quark()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_find_subcontent_by_quark()
: adquery.cxx
- gb_find_value_equal()
: adquery.cxx
- gb_findExtension()
: ad_save_load.cxx
, gb_prot.h
- GB_finish_stream_save()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_first_marked()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_first_non_key_char()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_fix_database()
: ad_prot.h
, adTest.cxx
- gb_fix_recursive()
: adTest.cxx
- GB_flush_cache()
: ad_prot.h
, adcache.cxx
- GB_follow_unix_link()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_following_marked()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_followingEntry()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_fopen_tempfile()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- gb_free_all_undos()
: adindex.cxx
- gb_free_cache()
: adcache.cxx
, gb_prot.h
- gb_free_compress_tree()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_free_dictionary()
: adoptimize.cxx
- GB_free_dictionary()
: adsystem.cxx
- GB_FREE_TRANSACTION_SAVE()
: gb_ts.h
- gb_free_undo_stack()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- gb_full_path()
: ad_save_load.cxx
- GB_get_arb_revision_tag()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- GB_get_callback_info()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- gb_get_compression_mask()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_get_db_path()
: ad_prot.h
, adTest.cxx
- GB_get_dictionary()
: ad_prot.h
, adsystem.cxx
- gb_get_dictionary()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- GB_get_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_get_father()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_get_gb_main_during_cb()
: ad_cb.cxx
, ad_prot.h
- GB_get_GBDATA_path()
: adquery.cxx
- GB_get_grandfather()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_get_macro_error()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- gb_get_main_during_cb()
: ad_cb.cxx
, gb_prot.h
- gb_get_number()
: ad_io_inline.h
- GB_get_quark()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_get_requested_undo_type()
: ad_prot.h
, adindex.cxx
- GB_get_root()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_get_root()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_get_subfields()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_get_supported_compression_flags()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_get_transaction_level()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_get_type_name()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_get_usable_memory()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getcwd()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- GB_GETDATA_TS()
: gb_ts.h
- GB_getenv()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvARB_GS()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvARB_PDFVIEW()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvARB_PROP()
: adsocket.cxx
- GB_getenvARB_XCMD()
: adsocket.cxx
- GB_getenvARB_XTERM()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvARBCONFIG()
: adsocket.cxx
- GB_getenvARBHOME()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvARBMACRO()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvARBMACROHOME()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvDOCPATH()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvHOME()
: adsocket.cxx
- GB_getenvHTMLDOCPATH()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_getenvPATH()
: adsocket.cxx
- GB_getenvUSER()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_GETMEMSIZE_TS()
: gb_ts.h
- GB_GETSIZE_TS()
: gb_ts.h
- GB_getuid_of_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_give_buffer()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_give_buffer2()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_give_buffer_size()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_give_other_buffer()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_GRANDPA()
: gb_data.h
- GB_has_key()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_have_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_HEADER_LIST_GBD()
: gb_header.h
- GB_host_is_local()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_IF_ENTRIES_GBD()
: gb_index.h
- GB_IF_ENTRIES_NEXT()
: gb_index.h
- GB_in_temporary_branch()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_increase_buffer()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_incur_error()
: arb_msg.h
- GB_incur_error_if()
: arb_msg.h
- GB_INDEX_FILES_ENTRIES()
: gb_index.h
- GB_INDEX_FILES_NEXT()
: gb_index.h
- gb_index_find()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- GB_info()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_info()
: arbdb.cxx
- GB_information()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_informationf()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_init_gb()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_init_undo_stack()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- GB_inside_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- GB_inside_remote_action()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- GB_install_getenv_hook()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_install_pid()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- GB_internal_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_internal_errorf()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_IO_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_is_ancestor_of()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_is_container()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_is_dictionary_compressed()
: ad_prot.h
, adcompr.cxx
- GB_is_directory()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_executablefile()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_fifo()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_in_buffer()
: arbdb.cxx
- GB_is_link()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_privatefile()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_readable()
: arb_file.cxx
- GB_is_readablefile()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_regularfile()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_is_server()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- GB_is_temporary()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_is_valid_mapfile()
: admap.cxx
, gb_prot.h
- gb_is_writeable()
: ad_save_load.cxx
- GB_is_writeablefile()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- gb_isMappedMemory()
: admap.cxx
, gb_prot.h
- GB_KEY()
: gb_key.h
- GB_KEY_QUARK()
: gb_key.h
- GB_last_saved_clock()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_last_saved_time()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_lib_file()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- gb_link_entry()
: ad_core.cxx
- gb_load_dictionary_data()
: adsystem.cxx
, gb_prot.h
- gb_load_key_data_and_dictionaries()
: adsystem.cxx
, gb_prot.h
- gb_load_single_key_data()
: adsystem.cxx
, gb_prot.h
- GB_log_fak()
: ad_prot.h
, admath.cxx
- GB_login()
: ad_load.cxx
- GB_MAIN()
: gb_data.h
- GB_MAIN_NO_FATHER()
: gb_data.h
- gb_make_container()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_make_entry()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_make_main_idx()
: ad_load.cxx
, gb_prot.h
- gb_make_pre_defined_container()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_make_pre_defined_entry()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_map_FILE()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_map_file()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- gb_map_mapfile()
: admap.cxx
, gb_prot.h
- GB_mapfile()
: ad_save_load.cxx
, ad_prot.h
- gb_mapfile_name()
: ad_save_load.cxx
, gb_prot.h
- GB_MEMCMP()
: adoptimize.cxx
- GB_memdup()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GB_mode_of_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_mode_of_link()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_move_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- gb_new_gb_transaction_save()
: ad_core.cxx
- GB_next_marked()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_nextChild()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_nextEntry()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_no_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_nsons()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_number_of_marked_subentries()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_number_of_subentries()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_oldQuicksaveName()
: ad_save_load.cxx
, gb_prot.h
- GB_open()
: ad_load.cxx
, ad_prot.h
- GB_open_DBs()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_optimize()
: ad_prot.h
, adoptimize.cxx
- gb_overwriteName()
: ad_save_load.cxx
- gb_parse_ascii()
: ad_load.cxx
- gb_parse_ascii_rek()
: ad_load.cxx
- GB_path_in_arb_temp()
: adsocket.cxx
- GB_path_in_ARBHOME()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_path_in_ARBLIB()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_path_in_arbprop()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_path_in_HOME()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_pop_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_pre_delete_entry()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_print_debug_information()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_print_error()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_property_file()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- GB_push_transaction()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_put_number()
: ad_io_inline.h
- gb_quicksaveName()
: ad_save_load.cxx
, gb_prot.h
- GB_raise_user_flag()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_random()
: ad_prot.h
, admath.cxx
- GB_random_seed()
: ad_prot.h
, admath.cxx
- GB_read_as_string()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
, AW_awar.cxx
- GB_read_as_tagged_string()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- gb_read_ascii_beyond_header()
: ad_load.cxx
- gb_read_bin()
: ad_load.cxx
- gb_read_bin_error()
: ad_save_load.cxx
, gb_prot.h
- gb_read_bin_rek_V2()
: ad_load.cxx
- GB_read_bits()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_bits_count()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_bits_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_byte()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_bytes()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_bytes_count()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_bytes_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_read_cache()
: adcache.cxx
, gb_prot.h
- GB_read_char_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_clients()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- GB_read_clock()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_count()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_read_dict_data()
: adsystem.cxx
- GB_read_file()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_read_flag()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_float()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_floats()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_floats_count()
: arbdb.cxx
- GB_read_floats_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_fp()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_read_from_floats()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_from_ints()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_read_in_uint32()
: ad_io_inline.h
- GB_read_int()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_ints()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_ints_count()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_ints_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_key()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_read_key_pntr()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_read_key_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_lossless_byte()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_lossless_float()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_lossless_int()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_memuse()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_read_nr()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_read_old_size()
: ad_cb.cxx
, ad_prot.h
- GB_read_old_value()
: ad_cb.cxx
, ad_prot.h
- GB_read_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_read_pntr_ts()
: ad_cb.cxx
- GB_read_pointer()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_security_delete()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_security_read()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_security_write()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_string()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_string_count()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_read_type()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_readable_as_string()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_recover_corrupt_file()
: ad_load.cxx
- gb_reffile_name()
: ad_save_load.cxx
- GB_release()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_remembered_db()
: arbdb.cxx
- gb_remove_all_but_main()
: ad_save_load.cxx
- GB_remove_all_callbacks_to()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- GB_remove_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- gb_remove_callbacks_marked_for_deletion()
: ad_cb.cxx
, gb_prot.h
- gb_remove_callbacks_that()
: ad_cb.cxx
- GB_remove_hierarchy_callback()
: ad_cb.cxx
, ad_cb_prot.h
- GB_remove_on_exit()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- gb_remove_quick_saved()
: ad_save_load.cxx
- GB_request_undo_type()
: ad_prot.h
, adindex.cxx
- GB_resort_data_base()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_resort_system_folder_to_top()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_safe_atof()
: arbdb.cxx
- GB_safe_copy_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_safe_rename_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_save()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_save_as()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_save_dictionary_data()
: adsystem.cxx
, gb_prot.h
- gb_save_extern_data_in_ts()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_save_extern_data_in_ts__and_uncache()
: arbdb.cxx
- GB_save_in_arbprop()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_save_mapfile()
: admap.cxx
, gb_prot.h
- GB_save_quick()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_save_quick_as()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_scan_directory()
: adfile.cxx
, gb_prot.h
- gb_search()
: adquery.cxx
, gb_prot.h
- GB_search()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- gb_search_marked()
: adquery.cxx
- gb_search_system_folder()
: ad_load.cxx
- gb_search_system_folder_rek()
: ad_load.cxx
- GB_searchOrCreate_float()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_searchOrCreate_int()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- GB_searchOrCreate_string()
: ad_prot.h
, adquery.cxx
- gb_security_error()
: arbdb.cxx
- GB_set_cache_size()
: ad_prot.h
, adcache.cxx
- gb_set_compression()
: arbdb.cxx
- GB_set_dictionary()
: ad_prot.h
, adsystem.cxx
- GB_set_export_sequence_hook()
: ad_prot.h
, adlang1.cxx
- GB_set_macro_error()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GB_set_mode_of_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_set_next_main_idx()
: ad_load.cxx
, ad_prot.h
- GB_set_remote_action()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- GB_set_temporary()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_set_time_of_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_set_undo_mem()
: ad_prot.h
, adindex.cxx
- gb_set_undo_sync()
: adindex.cxx
, gb_prot.h
- gb_set_undo_type()
: adindex.cxx
- gb_set_update_in_server_flags()
: ad_core.cxx
- GB_set_verbose()
: ad_load.cxx
, ad_prot.h
- GB_setenv()
: adsocket.cxx
- GB_size_of_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_size_of_FILE()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_sort()
: arb_sort.cxx
, arb_sort.h
- GB_split_full_path()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_start_streamed_save_as()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- gb_stpcpy()
: arbdb.cxx
- GB_stream_save_part()
: ad_prot.h
, ad_save_load.cxx
- GB_string_comparator()
: arb_sort.cxx
, arb_sort.h
- GB_supports_mapfile()
: ad_prot.h
, admap.cxx
- GB_symlink()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- gb_system_key_changed_cb()
: adsystem.cxx
- gb_system_master_changed_cb()
: adsystem.cxx
- GB_tell_server_dont_wait()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- GB_test_delete_possible()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_test_transaction()
: gb_ta.h
- GB_textprint()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_time_of_day()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_time_of_file()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- GB_touch()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_touch_entry()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_touch_header()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_transactable_type()
: arbdb.cxx
- GB_type_2_char()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_TYPE_readable_as_string()
: arbdb.h
- gb_type_readable_from()
: arbdb.cxx
- GB_TYPE_TS()
: gb_ts.h
- gb_type_writeable_to()
: arbdb.cxx
- GB_TYPES_2_name()
: arbdb.cxx
- gb_uncache()
: adcache.cxx
, gb_prot.h
- gb_uncompress_bits()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_uncompress_by_dictionary()
: adoptimize.cxx
, gb_prot.h
- gb_uncompress_by_dictionary_internal()
: adoptimize.cxx
- gb_uncompress_by_sequence()
: adseqcompr.cxx
, gb_t_prot.h
- gb_uncompress_bytes()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_uncompress_data()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- gb_uncompress_equal_bytes()
: adcompr.cxx
- gb_uncompress_huffmann()
: adcompr.cxx
- gb_uncompress_longs()
: adcompr.cxx
- gb_uncompress_longs_old()
: adcompr.cxx
, gb_prot.h
- GB_undo()
: ad_prot.h
, adindex.cxx
- GB_undo_info()
: ad_prot.h
, adindex.cxx
- gb_unfold()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_unfold_in_directory()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_unfold_path()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_unique_filename()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GB_unlink()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- gb_unlink_entry()
: ad_core.cxx
- GB_unlink_or_warn()
: arb_file.cxx
, arb_file.h
- gb_untouch_children()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_untouch_children_and_me()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- gb_untouch_me()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_user_flag()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_warning()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
, seq_search.cxx
- GB_warning_if()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_warningf()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GB_write_autoconv_string()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_write_bin()
: ad_save_load.cxx
- gb_write_bin_rek()
: ad_save_load.cxx
- gb_write_bin_sub_containers()
: ad_save_load.cxx
- GB_write_bits()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_byte()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_bytes()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_write_childs()
: ad_save_load.cxx
- gb_write_compressed_pntr()
: arbdb.cxx
, gb_prot.h
- GB_write_flag()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_float()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_floats()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_write_index_key()
: ad_core.cxx
, gb_prot.h
- GB_write_int()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_ints()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_write_key()
: ad_core.cxx
- GB_write_lossless_byte()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_lossless_float()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_lossless_int()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- gb_write_one_child()
: ad_save_load.cxx
- gb_write_out_uint32()
: ad_io_inline.h
- GB_write_pntr()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_pointer()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_security_delete()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_security_levels()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_security_read()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_security_write()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_string()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_write_user_flag()
: ad_prot.h
, arbdb.cxx
- GB_xcmd()
: ad_prot.h
, adsocket.cxx
- GBC_await_error()
: ad_prot.h
, adperl.cxx
- gbcm_login()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_logout()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_open_socket()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_read()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_read_bin()
: adcomm.cxx
- gbcm_read_buffered()
: adsocket.cxx
- gbcm_read_flush()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_read_long()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_read_string()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_read_two()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_unfold_client()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_write()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_write_bin()
: adcomm.cxx
- gbcm_write_flush()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_write_long()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_write_string()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcm_write_two()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_abort_transaction()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_begin_sendupdate()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_begin_transaction()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_close()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_commit_transaction()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_end_sendupdate()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- GBCMC_find()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- gbcmc_init_transaction()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_key_alloc()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_open()
: adsocket.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_read_keys()
: adcomm.cxx
- gbcmc_send_undo_commands()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_send_undo_info_commands()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_sendupdate_create()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_sendupdate_delete()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_sendupdate_update()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcmc_unfold_list()
: adcomm.cxx
- GBCMS_accept_calls()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- gbcms_add_to_delete_list()
: adcomm.cxx
, gb_prot.h
- gbcms_close()
: gb_prot.h
- GBCMS_open()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- gbcms_shift_delete_list()
: adcomm.cxx
- GBCMS_shutdown()
: ad_prot.h
, adcomm.cxx
- gbcms_sighup()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_abort_transaction()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_begin_transaction()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_close()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_commit_transaction()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_disable_wait_for_new_request()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_find()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_get_update()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_init_transaction()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_key_alloc()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_obsolete()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_put_update()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_undo()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_unfold()
: adcomm.cxx
- gbcms_talking_updated()
: adcomm.cxx
- gbcms_write_deleted()
: adcomm.cxx
- gbcms_write_keys()
: adcomm.cxx
- gbcms_write_updated()
: adcomm.cxx
- GBCONTAINER_ELEM()
: gb_header.h
- GBCONTAINER_IFS()
: gb_index.h
- GBCONTAINER_MAIN()
: gb_data.h
- GBK_assert_msg()
: arb_core.h
, arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_doublequote()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_dump_backtrace()
: arb_core.h
, arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_dump_former_backtrace()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_free_backtrace()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_get_backtrace()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_getNonfreeableAddress()
: arb_core.h
, arb_signal.cxx
, arb_signal.h
- GBK_install_SIGSEGV_handler()
: arb_core.h
, arb_signal.cxx
, arb_signal.h
- GBK_raises_SIGSEGV()
: arb_core.h
, arb_signal.cxx
, arb_signal.h
- GBK_running_on_valgrind()
: arb_core.h
, arb_signal.cxx
, arb_signal.h
- GBK_singlequote()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_system()
: arb_core.h
, arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_terminate()
: arb_core.h
, arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_terminate_on_error()
: arb_msg.h
- GBK_terminatef()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBK_test_address()
: arb_signal.cxx
, arb_signal.h
- gbl_ali_name()
: adlang1.cxx
- gbl_and()
: adlang1.cxx
- gbl_apply_binary_operator()
: adlang1.cxx
- gbl_caps()
: adlang1.cxx
- gbl_change_gc()
: adlang1.cxx
- gbl_checksum()
: adlang1.cxx
- gbl_colsplit()
: adlang1.cxx
- gbl_command()
: adlang1.cxx
- gbl_compare()
: adlang1.cxx
- gbl_contains()
: adlang1.cxx
- gbl_count()
: adlang1.cxx
- gbl_crop()
: adlang1.cxx
- gbl_cut()
: adlang1.cxx
- gbl_dd()
: adlang1.cxx
- gbl_define()
: adlang1.cxx
- gbl_diff()
: adlang1.cxx
- gbl_div()
: adlang1.cxx
- gbl_do()
: adlang1.cxx
- gbl_drop()
: adlang1.cxx
- gbl_dropempty()
: adlang1.cxx
- gbl_dropzero()
: adlang1.cxx
- gbl_echo()
: adlang1.cxx
- gbl_equals()
: adlang1.cxx
- gbl_escape()
: adlang1.cxx
- gbl_eval()
: adlang1.cxx
- gbl_exec()
: adlang1.cxx
- gbl_export_sequence()
: adlang1.cxx
- gbl_extract_sequence()
: adlang1.cxx
- gbl_extract_words()
: adlang1.cxx
- gbl_fdiv()
: adlang1.cxx
- gbl_filter()
: adlang1.cxx
- gbl_findacc()
: adlang1.cxx
- gbl_findgene()
: adlang1.cxx
- gbl_findspec()
: adlang1.cxx
- gbl_fminus()
: adlang1.cxx
- gbl_fmult()
: adlang1.cxx
- gbl_format()
: adlang1.cxx
- gbl_format_sequence()
: adlang1.cxx
- gbl_fper_cent()
: adlang1.cxx
- gbl_fplus()
: adlang1.cxx
- gbl_gcgchecksum()
: adlang1.cxx
- gbl_head()
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- gbl_icompare()
: adlang1.cxx
- gbl_icontains()
: adlang1.cxx
- gbl_iequals()
: adlang1.cxx
- gbl_inRange()
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- gbl_ipartof()
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- gbl_isBelow()
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: adlang1.cxx
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- gbl_per_cent()
: adlang1.cxx
- gbl_plus()
: adlang1.cxx
- gbl_pretab()
: adlang1.cxx
- gbl_quote()
: adlang1.cxx
- gbl_read_seq_sai_or_species()
: adlang1.cxx
- gbl_readdb()
: adlang1.cxx
- gbl_remove()
: adlang1.cxx
- gbl_rest()
: adlang1.cxx
- gbl_round()
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: adlang1.cxx
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- gbl_swap()
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: adlang1.cxx
- gbl_taxonomy()
: adlang1.cxx
- gbl_toback()
: adlang1.cxx
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- gbl_translate()
: adlang1.cxx
- gbl_unescape()
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- gbl_unquote()
: adlang1.cxx
- gbl_upper()
: adlang1.cxx
- gbm_debug_mem()
: admalloc.cxx
, gb_prot.h
- gbm_flush_mem()
: admalloc.cxx
, gb_prot.h
- gbm_free_mem()
: gb_memory.h
- gbm_get_mem()
: gb_memory.h
- gbm_get_memblk()
: admalloc.cxx
- gbm_init_mem()
: admalloc.cxx
, gb_prot.h
- gbm_put_memblk()
: admalloc.cxx
- gbmFreeMemImpl()
: admalloc.cxx
, gb_memory.h
- gbmGetMemImpl()
: gb_memory.h
, admalloc.cxx
- GBP_add_callback()
: ARB_ext.c
- GBP_callback()
: ARB_ext.c
- GBP_charPtr_2_GB_alignment_type()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_charPtr_2_GB_CASE()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_charPtr_2_GB_SEARCH_TYPE()
: adperl.cxx
, ad_p_prot.h
- GBP_charPtr_2_GB_TYPES()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_charPtr_2_GB_UNDO_TYPE()
: adperl.cxx
, ad_p_prot.h
- gbp_create_callback_hashkey()
: ARB_ext.c
- GBP_croak()
: ARB_ext.c
- GBP_GB_alignment_type_2_charPtr()
: adperl.cxx
, ad_p_prot.h
- GBP_GB_CASE_2_charPtr()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_GB_SEARCH_TYPE_2_charPtr()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_GB_TYPES_2_charPtr()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_GB_UNDO_TYPE_2_charPtr()
: adperl.cxx
, ad_p_prot.h
- GBP_prepare_to_die()
: ad_p_prot.h
, adperl.cxx
- GBP_remove_callback()
: ARB_ext.c
- GBS_add_ptserver_logentry()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- gbs_build_replace_string()
: admatch.cxx
- GBS_checksum()
: adstring.cxx
, ad_prot.h
- gbs_cmp_strings()
: MG_checkfield.cxx
- GBS_compile_matcher()
: ad_prot.h
, admatch.cxx
- GBS_compile_regexpr()
: arb_match.cxx
, arb_match.h
- gbs_compress_command()
: admatch.cxx
- GBS_create_dynaval_hash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_create_hash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_create_numhash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_dynaval_free()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_erase_hash()
: adhash.cxx
- GBS_erase_numhash()
: adhash.cxx
- GBS_escape_string()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_eval_env()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_fconvert_string()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_find_string()
: ad_prot.h
, arbdb.h
, admatch.cxx
- GBS_fread_string()
: adstring.cxx
- GBS_free_hash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_free_matcher()
: ad_prot.h
, admatch.cxx
- GBS_free_numhash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_free_regexpr()
: arb_match.cxx
, arb_match.h
- GBS_funptr2readable()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_fwrite_string()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_gcgchecksum()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- gbs_get_a_prime()
: adhash.cxx
, gb_prot.h
- GBS_get_arb_tcp_entries()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- GBS_global_string()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
, defs.h
- GBS_global_string_copy()
: arb_msg.h
, arb_msg.cxx
- GBS_global_string_to_buffer()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBS_hash_do_const_loop()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_hash_do_const_sorted_loop()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_hash_do_loop()
: adhash.cxx
, ad_prot.h
- GBS_hash_do_sorted_loop()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_hash_elements()
: adhash.cxx
, ad_prot.h
- GBS_hash_next_element_that()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- gbs_hash_to_strstruct()
: adhash.cxx
- GBS_hashtab_2_string()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_HCF_sortedByKey()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_incr_hash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_log_action_to()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_merge_tagged_strings()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_modify_tagged_string_with_ACI()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_nameserver_tag()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- gbs_numhash_index()
: adhash.cxx
- GBS_optimize_hash()
: adhash.cxx
, ad_prot.h
- GBS_ptserver_id_to_choice()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- GBS_ptserver_logname()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- GBS_ptserver_tag()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- GBS_read_arb_tcp()
: ad_prot.h
, adtcp.cxx
- GBS_read_dir()
: ad_prot.h
, adfile.cxx
- GBS_read_hash()
: adhash.cxx
, ad_prot.h
- GBS_read_numhash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_readable_size()
: arb_misc.h
, arb_misc.cxx
- GBS_readable_timediff()
: arb_misc.cxx
, arb_misc.h
- GBS_regmatch()
: arb_match.cxx
, arb_match.h
- GBS_regmatch_compiled()
: arb_match.cxx
, arb_match.h
- GBS_regreplace()
: arb_match.h
, arb_match.cxx
- GBS_replace_tabs_by_spaces()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_restore_global_buffers()
: arb_msg.h
, arb_msg.cxx
- GBS_reuse_buffer()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBS_scan_arb_tcp_param()
: adtcp.cxx
, ad_prot.h
- gbs_scan_db_compare()
: adtools.cxx
- gbs_scan_db_insert()
: adtools.cxx
- GBS_shorten_repeated_data()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_static_string()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBS_store_global_buffers()
: arb_msg.h
, arb_msg.cxx
- GBS_string_2_key()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_string_2_key_with_exclusions()
: adstring.cxx
- GBS_string_eval()
: ad_prot.h
, admatch.cxx
- GBS_string_eval_in_env()
: ad_prot.h
, admatch.cxx
- GBS_string_matches()
: ad_prot.h
, admatch.cxx
- GBS_string_matches_regexp()
: ad_prot.h
, admatch.cxx
- GBS_trim()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_unescape_string()
: ad_prot.h
, adstring.cxx
- GBS_unwrap_regexpr()
: arb_match.cxx
, arb_match.h
- GBS_vglobal_string()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBS_vglobal_string_copy()
: arb_msg.cxx
, arb_msg.h
- GBS_write_hash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_write_hash_no_strdup()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBS_write_numhash()
: ad_prot.h
, adhash.cxx
- GBT_abort_rename_session()
: ad_t_prot.h
, adname.cxx
- GBT_add_alignment_changekeys()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_add_data()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_add_item_to_hash()
: adhashtools.cxx
- GBT_add_new_changekey()
: adChangeKey.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_add_new_changekey_to_keypath()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_add_new_experiment_changekey()
: adChangeKey.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_add_new_gene_changekey()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_add_new_species_changekey()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_begin_rename_session()
: ad_t_prot.h
, adname.cxx
- GBT_check_alignment()
: adali.cxx
- GBT_check_alignment_name()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_check_arb_file()
: ad_load.cxx
, ad_prot.h
- GBT_check_data()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_check_tree_name()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_colorset_root()
: ad_colorset.cxx
, ad_colorset.h
- GBT_commit_rename_session()
: ad_t_prot.h
, adname.cxx
- GBT_complementNucleotide()
: adRevCompl.cxx
- GBT_complementNucSequence()
: ad_t_prot.h
, adRevCompl.cxx
- GBT_compress_sequence_tree2()
: adseqcompr.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_compression_test()
: ad_t_prot.h
- GBT_convert_changekey()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_copy_alignment()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_copy_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_count_alignments()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_count_leafs()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_count_marked_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_create()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_create_alignment()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_create_marked_species_hash()
: ad_prot.h
, adhashtools.cxx
- GBT_create_organism_hash()
: ad_prot.h
, adhashtools.cxx
- GBT_create_SAI_hash()
: ad_prot.h
, adhashtools.cxx
- GBT_create_sequence_data()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_create_species_hash()
: ad_prot.h
, adhashtools.cxx
- GBT_create_species_hash_sized()
: ad_prot.h
, adhashtools.cxx
- GBT_create_unique_item_identifier()
: aditem.cxx
- GBT_create_unique_species_name()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_delete_alignment()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_determine_T_or_U()
: adRevCompl.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_existing_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_expect_item_rel_item_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_expect_SAI()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_expect_SAI_rel_SAI_data()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_expect_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_expect_species_rel_species_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_find_bottom_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_find_colorset()
: ad_colorset.h
, ad_colorset.cxx
- GBT_find_configuration()
: ad_config.cxx
, ad_config.h
- GBT_find_item_rel_item_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_find_next_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_find_or_create()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_find_or_create_colorset()
: ad_colorset.cxx
, ad_colorset.h
- GBT_find_or_create_item_rel_item_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_find_or_create_SAI()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_find_or_create_species()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_find_or_create_species_rel_species_data()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_find_SAI()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_find_SAI_rel_SAI_data()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_find_sequence()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_find_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_find_species_rel_species_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_find_top_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_find_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_first_marked_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_first_marked_species_rel_species_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_first_SAI()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_first_SAI_rel_SAI_data()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_first_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_first_species_rel_species_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_free_rename_session_data()
: adname.cxx
- GBT_gen_accession_number()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_gen_species_array()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_get_alignment()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_alignment_len()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_get_alignment_names()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_alignment_type()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_get_alignment_type_string()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_get_changekey()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_get_color_group()
: ad_colorset.cxx
, ad_colorset.h
- GBT_get_colorset_names()
: ad_colorset.h
, ad_colorset.cxx
- GBT_get_configuration_names()
: ad_config.cxx
, ad_config.h
- GBT_get_default_alignment()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_get_default_helix()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_get_default_helix_nr()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_get_default_ref()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_get_item_count()
: aditem.cxx
- GBT_get_name()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_get_name_or_description()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_names_of_species_in_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_get_presets()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_SAI_count()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_SAI_data()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_get_species_count()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_species_data()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_startup_alignment()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_tree_data()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_tree_name()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_get_tree_names()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_get_type_of_changekey()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_install_message_handler()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_invalid_because()
: adtree.cxx
- GBT_is_alignment_protein()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- gbt_is_invalid()
: adtree.cxx
- GBT_is_invalid()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_is_partial()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_join_strings()
: arb_strarray.cxx
, arb_strarray.h
- GBT_link_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_link_tree_to_hash_rek()
: adtree.cxx
- GBT_link_tree_using_species_hash()
: adtree.cxx
- GBT_load_colorset()
: ad_colorset.cxx
, ad_colorset.h
- GBT_log_to_named_trees_remark()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_log_to_tree_remark()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_macro_execute()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_mark_all()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_mark_all_that()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_message()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_move_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_name_of_bottom_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_name_of_largest_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_next_marked_species()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_next_SAI()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_next_species()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_nonexisting_alignment()
: adali.cxx
- GBT_open()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_overwrite_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_read_as_string()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_read_char_pntr()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_read_float()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_read_gene_sequence()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_read_gene_sequence_and_length()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_read_int()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_read_name()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_read_string()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_read_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_read_tree_and_size()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_read_tree_rek()
: adtree.cxx
- GBT_readOrCreate_char_pntr()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_readOrCreate_float()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_readOrCreate_int()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_readOrCreate_string()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_relativeMacroname()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_remote_action()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_remote_action_with_timeout()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_remote_awar()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_remote_read_awar()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_remove_leafs()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_rename_alignment()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_rename_alignment_of_item()
: adali.cxx
- GBT_rename_species()
: adname.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_rename_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- gbt_rename_tree_rek()
: adname.cxx
- GBT_restore_marked_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_reverseComplementNucSequence()
: ad_t_prot.h
, adRevCompl.cxx
- GBT_reverseNucSequence()
: ad_t_prot.h
, adRevCompl.cxx
- GBT_save_colorset()
: ad_colorset.cxx
, ad_colorset.h
- GBT_scan_db()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- gbt_scan_db_rek()
: adtools.cxx
- gbt_scan_db_start()
: adtools.cxx
- GBT_searchOrCreate_itemfield_according_to_changekey()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_set_alignment_len()
: adali.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_set_color_group()
: ad_colorset.cxx
, ad_colorset.h
- GBT_set_default_alignment()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- GBT_set_startup_alignment()
: ad_t_prot.h
, adali.cxx
- gbt_set_type_of_changekey()
: adChangeKey.cxx
- GBT_size_of_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_split_string()
: arb_strarray.h
- GBT_splitNdestroy_string()
: arb_strarray.cxx
, arb_strarray.h
- GBT_store_marked_species()
: aditem.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_tree_2_newick()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_tree_behind()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_tree_info_string()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_tree_infrontof()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_TREE_order()
: CT_rbtree.cxx
- GBT_unlink_tree()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- gbt_wait_for_remote_action()
: adtools.cxx
- GBT_with_stored_species()
: ad_t_prot.h
, aditem.cxx
- GBT_write_byte()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_write_float()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_write_float_converted()
: ad_t_prot.h
, adChangeKey.cxx
- GBT_write_group_name()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_write_int()
: adtools.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_write_int_converted()
: adChangeKey.cxx
, ad_t_prot.h
- GBT_write_name_to_groupData()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_write_string()
: ad_t_prot.h
, adtools.cxx
- GBT_write_tree()
: adtree.cxx
, ad_t_prot.h
- gbt_write_tree()
: adtree.cxx
- gbt_write_tree_nodes()
: adtree.cxx
- gbt_write_tree_rek_new()
: adtree.cxx
- GBT_write_tree_remark()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- GBT_write_tree_with_remark()
: ad_t_prot.h
, adtree.cxx
- gc_awarname()
: AW_preset.cxx
- gc_change_cb()
: ED4_root.cxx
- gc_changed_cb()
: DI_view_matrix.cxx
, PH_main.cxx
- gc_color_changed_cb()
: AW_preset.cxx
- gc_fontOrSize_changed_cb()
: AW_preset.cxx
- gc_minmax_changed_cb()
: probe_design.cxx
- gcg_checksum()
: gcg.cxx
- gcg_date()
: prototypes.h
, date.cxx
- gcg_doc_out()
: gcg.cxx
- gcg_out_origin()
: gcg.cxx
- gcg_seq_out()
: gcg.cxx
- GCGchecksum()
: ureadseq.c
, ureadseq.h
- gcman_awarname()
: AW_preset.cxx
- gcman_specific_awarname()
: AW_preset.cxx
- GDE_create_filename_browser_window()
: GDE.cxx
- gde_filter_weights()
: GDE.cxx
- GDE_freesequ()
: GDE_event.cxx
- GDE_init()
: gde.hxx
, GDE_proto.h
, GDE.cxx
- GDE_load_menu()
: GDE.cxx
, GDE_proto.h
, gde.hxx
- GDE_makeawarname()
: GDE.cxx
, GDE_proto.h
- GDE_makeawarname_in()
: GDE.cxx
- GDE_maketmpawarname()
: GDE.cxx
, GDE_proto.h
- GDE_menuitem_cb()
: GDE.cxx
- GDE_popup_filename_browser()
: GDE.cxx
- GDE_showhelp_cb()
: GDE.cxx
- GDE_startaction_cb()
: GDE_event.cxx
, GDE_proto.h
- GEN_add_global_awar_callbacks()
: GEN_map.cxx
- GEN_add_local_awar_callbacks()
: GEN_map.cxx
- GEN_add_pseudo_species_to_hash()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_create_awars()
: GEN_interface.cxx
, GEN.hxx
- GEN_create_field_items()
: GEN_interface.cxx
- GEN_create_first_map()
: GEN.hxx
, GEN_map.cxx
- GEN_create_gc_window()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_gene_query_window()
: GEN_interface.cxx
, GEN.hxx
- GEN_create_gene_species_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_genemap_global_awars()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_genemap_local_awars()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_genes_submenu()
: GEN.hxx
, GEN_map.cxx
- GEN_create_hide_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_map()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_mask_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_nds_vars()
: GEN_nds.hxx
, GEN_nds.cxx
- GEN_create_nonexisting_gene()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_create_nonexisting_gene_rel_gene_data()
: adGene.cxx
- GEN_create_options_window()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_organism_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_create_pseudo_species_hash()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- gen_display()
: MP_Window.cxx
- GEN_display_param_changed_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_expect_gene()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_expect_gene_data()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- gen_extract_gene_2_pseudoSpecies()
: GEN_map.cxx
- GEN_find_gene()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- gen_find_gene_by_id()
: GEN_interface.cxx
- GEN_find_gene_data()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_find_gene_rel_gene_data()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_find_or_create_gene_rel_gene_data()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_find_organism()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_find_origin_gene()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_find_origin_organism()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_find_pseudo_species()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_find_windowNr_for()
: GEN_map.cxx
- GEN_findOrCreate_gene_data()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_first_gene()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_first_gene_rel_gene_data()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_first_marked_gene()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_first_marked_organism()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_first_marked_pseudo_species()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_first_organism()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_first_pseudo_species()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_free_position()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_gene_container_cb_installer()
: GEN_map.cxx
- GEN_gene_container_changed_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_get_current_gene()
: GEN_interface.cxx
- GEN_get_current_organism()
: GEN_interface.cxx
, GEN.hxx
- GEN_get_first_gene_data()
: GEN_interface.cxx
- gen_get_gene_id()
: GEN_interface.cxx
- GEN_get_local_gene_data()
: GEN_map.cxx
- GEN_get_next_gene_data()
: GEN_interface.cxx
- GEN_get_organism_count()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_get_selector()
: GEN.hxx
, GEN_interface.cxx
- GEN_global_gene_identifier()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_hide_command()
: GEN_map.cxx
- GEN_insert_extract_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_insert_hide_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_insert_mark_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_insert_multi_submenu()
: GEN_map.cxx
- GEN_is_genome_db()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_is_organism()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_is_pseudo_gene_species()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_jump_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_jump_cb_auto()
: GEN_map.cxx
- GEN_local_lock_changed_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_local_organism_or_gene_name_changed_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_make_node_text_init()
: GEN_nds.hxx
, GEN_nds.cxx
- GEN_make_node_text_nds()
: GEN_nds.cxx
, GEN_nds.hxx
- GEN_map_window_refresh()
: GEN_map.cxx
- GEN_map_window_refresh_if_display_type()
: GEN_map.cxx
- GEN_mark_command()
: GEN_map.cxx
- GEN_mark_organism_or_corresponding_organism()
: GEN_interface.cxx
, GEN_local.hxx
- GEN_mode_event()
: GEN_map.cxx
- GEN_NDS_changed()
: GEN_map.cxx
- GEN_new_position()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_next_gene()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_next_marked_gene()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_next_marked_organism()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_next_marked_pseudo_species()
: adGene.cxx
- GEN_next_organism()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_next_pseudo_species()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_open_mask_window()
: GEN_map.cxx
- GEN_open_nds_window()
: GEN_nds.cxx
, GEN_nds.hxx
- GEN_organism_not_found()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_organism_or_gene_changed_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_origin_gene()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_origin_organism()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_perform_command()
: GEN_map.cxx
- GEN_popup_gene_infowindow()
: GEN.hxx
, GEN_interface.cxx
- GEN_read_position()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_read_pseudo_species_from_hash()
: adGene.cxx
- GEN_refresh_all_windows()
: GEN_local.hxx
, GEN_map.cxx
- gen_restore_old_species_marks()
: GEN_interface.cxx
- GEN_select_gene()
: GEN_interface.cxx
- GEN_set_display_style()
: GEN_map.cxx
- GEN_sortAndMergeLocationParts()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- GEN_species_add_entry()
: GEN_map.cxx
- GEN_species_name_changed_cb()
: GEN_interface.cxx
- GEN_testAndRemoveTranslations()
: GEN.hxx
, GEN_translations.cxx
- GEN_undo_cb()
: GEN_map.cxx
- GEN_update_combined_cb()
: GEN_interface.cxx
- GEN_update_GENE_CONTENT()
: GEN_interface.cxx
- GEN_update_unlocked_organism_and_gene_awars()
: GEN_map.cxx
- GEN_use_uncertainties()
: ad_prot.h
, adGene.cxx
- GEN_window_local_awar_name()
: GEN_local.hxx
, GEN_map.cxx
- GEN_write_position()
: adGene.cxx
, ad_prot.h
- genbank_check_blanks()
: genbank.cxx
- genbank_comments()
: genbank.cxx
- genbank_continue_line()
: genbank.cxx
- genbank_date()
: prototypes.h
, date.cxx
- genbank_get_atcc()
: mg.cxx
- genbank_get_strain()
: mg.cxx
- genbank_get_subspecies()
: mg.cxx
- genbank_key_word()
: prototypes.h
, genbank.cxx
- genbank_one_comment_entry()
: genbank.cxx
- genbank_one_entry_in()
: genbank.cxx
- genbank_origin()
: genbank.cxx
- genbank_out()
: genbank.cxx
, prototypes.h
- genbank_out_base_count()
: genbank.cxx
, prototypes.h
- genbank_out_header()
: genbank.cxx
, prototypes.h
- genbank_out_one_entry()
: genbank.cxx
- genbank_out_one_reference()
: genbank.cxx
- genbank_out_origin()
: genbank.cxx
- genbank_print_comment_if_content()
: genbank.cxx
- genbank_print_completeness()
: genbank.cxx
- genbank_print_lines()
: genbank.cxx
- genbank_reference()
: genbank.cxx
- genbank_skip_unidentified()
: genbank.cxx
- genbank_source()
: genbank.cxx
- genbank_to_gcg()
: gcg.cxx
- genbank_verify_accession()
: genbank.cxx
- genbank_verify_keywords()
: genbank.cxx
- gene_changed_cb()
: GEN_interface.cxx
- gene_copy_cb()
: GEN_interface.cxx
- gene_copy_handler()
: GEN_interface.cxx
- gene_create_cb()
: GEN_interface.cxx
- gene_delete_cb()
: GEN_interface.cxx
- gene_extract_cb()
: GEN_map.cxx
- gene_extract_handler()
: GEN_map.cxx
- gene_field_selection_list_rescan()
: item_sel_list.h
, changekey.cxx
- gene_field_selection_list_unhide_all_cb()
: item_sel_list.h
, changekey.cxx
- gene_field_selection_list_update_cb()
: item_sel_list.h
, changekey.cxx
- gene_rel_2_abs()
: PT_match.cxx
- gene_rename_cb()
: GEN_interface.cxx
- gene_rename_handler()
: GEN_interface.cxx
- gene_requires()
: probe_design.cxx
- generate_config_from_mapping_cb()
: AWT_config_manager.cxx
- generateReport()
: UnitTester.cxx
- genom_flag_changed()
: AWTI_import.cxx
- get_abs_align_pos()
: PT_buildtree.cxx
- get_active_macro_recording_tracker()
: trackers.hxx
- get_addid()
: AW_rename.cxx
- get_alitype_eval()
: NT_concatenate.cxx
- get_and_fix_range_from_awar()
: ui_species.cxx
- get_atcc()
: mg.cxx
- get_atcc_string()
: mg.cxx
- get_available_fontsizes()
: AW_xfont.cxx
- get_AW_ROOT_DEFAULT()
: aw_base.hxx
, aw_root.hxx
- get_awar_name()
: MG_main.cxx
- get_blocksize_description()
: pt_prototypes.h
- get_bond_val()
: pt_split.h
- get_cached_taxonomy()
: adlang1.cxx
- get_canvas_able_to_show()
: NT_group_search.cxx
- get_canvas_awar()
: NT_edconf.cxx
- get_Codon_Group()
: AP_codon_table.cxx
- get_colorset_root()
: db_query.cxx
- get_command_entry()
: db_server.cxx
- get_COMMON_CNT()
: aisc_extern.c
, aisc_extern_privat.h
- get_COMMON_LAST()
: aisc_extern_privat.h
, aisc_extern.c
- get_COMMON_PARENT()
: aisc_extern.c
, aisc_extern_privat.h
- get_complement()
: PT_complement.h
- get_config_awar()
: NT_edconf.cxx
- get_current_experiment_data()
: EXP_interface.cxx
- get_current_gene_data()
: GEN_interface.cxx
- get_current_time()
: arb_string.cxx
- get_data_n_size()
: adoptimize.cxx
- get_db_path()
: AW_global_awars.cxx
- get_DB_state()
: PT_main.cxx
- get_default_alignment()
: adali.cxx
- get_design_hinfo()
: PT_new_design.cxx
, pt_prototypes.h
- get_design_info()
: pt_prototypes.h
, PT_new_design.cxx
- get_disabled_advices()
: AW_advice.cxx
- get_display_toggle_awar()
: NT_edconf.cxx
- get_downgroups()
: DI_foundclusters.cxx
- get_drawsize()
: AWT_canio.cxx
- get_estimated_memory()
: primer_design.cxx
- get_existing_configs()
: AWT_config_manager.cxx
- get_father()
: probe_tree.h
- get_file_content_for_viewer()
: AWTI_edit.cxx
- get_first_organism()
: species.cxx
- get_first_SAI()
: SAIs.cxx
- get_first_SAI_data()
: SAIs.cxx
- get_first_selected_species()
: ED4_root.cxx
- get_first_species()
: species.cxx
- get_first_species_data()
: species.cxx
- get_first_tree()
: adtree.cxx
- get_formatter()
: PT_new_design.cxx
- get_full_qualified_help_file_name()
: AW_help.cxx
- get_gb_main()
: merge.hxx
- get_gene_create_or_locationEdit_window()
: GEN_interface.cxx
- get_gene_struct_by_arb_species_gene_name()
: PT_etc.cxx
- get_gene_struct_by_internal_gene_name()
: PT_etc.cxx
- get_global_alignments()
: MG_preserves.cxx
- get_group_consensus()
: ED4_root.cxx
- get_GroupRename_customized_ACI_commands()
: group_search.cxx
- get_GroupXfer_customized_ACI_commands()
: NT_tree_cmp.cxx
- get_helix_string()
: ED4_root.cxx
- get_ident()
: aisc_commands.c
- get_importedSpecies_selector()
: AWTI_edit.cxx
- get_interface_id()
: graph_aligner_gui.cxx
- get_itemfield_type_awarname()
: item_sel_list.cxx
, item_sel_list.h
- get_list_part()
: PT_etc.cxx
- get_load_count()
: DI_matr.cxx
- get_local_help_url()
: AW_help.cxx
- get_LOCS_ERROR()
: PT_extern.c
- get_match_acc()
: PT_match.cxx
, pt_prototypes.h
- get_match_hinfo_formatted()
: PT_match.cxx
- get_match_info_formatted()
: PT_match.cxx
- get_match_overlay()
: pt_prototypes.h
, PT_match.cxx
- get_match_start()
: PT_match.cxx
, pt_prototypes.h
- get_match_stop()
: pt_prototypes.h
, PT_match.cxx
- get_max_probelen()
: PT_new_design.cxx
- get_max_slider_xpos()
: ED4_no_class.cxx
- get_max_slider_ypos()
: ED4_no_class.cxx
- get_max_tree_idx()
: adtree.cxx
- get_memsize_of_saved()
: PT_prefixtree.cxx
- get_next_organism()
: species.cxx
- get_next_SAI()
: SAIs.cxx
- get_next_SAI_count()
: arb_dnarates.cxx
- get_next_SAI_data()
: SAIs.cxx
- get_next_selected_species()
: ED4_root.cxx
- get_next_species()
: species.cxx
- get_next_species_data()
: species.cxx
- get_next_tree()
: adtree.cxx
- get_nn_range_from_awars()
: ui_species.cxx
- get_objspec_registry()
: ED4_objspec.cxx
- get_overlay_files()
: ColumnStat_2_gnuplot.cxx
- get_param_entry()
: db_server.cxx
- get_physical_memory()
: adsocket.cxx
- get_probe_collection()
: probe_collection.cxx
, probe_collection.hxx
- get_random()
: MultiProbe.hxx
, MP_noclass.cxx
- get_reference_species_names()
: MG_species.cxx
- get_result_entry()
: db_server.cxx
- get_results_manager()
: probe_collection.hxx
, probe_collection.cxx
- get_SAI_description()
: AWT_sel_boxes.cxx
- get_SAI_group()
: ad_ext.cxx
- get_SAI_groups()
: ad_ext.cxx
- get_SAI_id()
: SAIs.cxx
- get_selected_configs_from_awar()
: NT_edconf.cxx
- get_selected_FTS()
: xfergui.cxx
- get_selected_imported_species()
: AWTI_edit.cxx
- get_selected_organism()
: species.cxx
- get_selected_range()
: ED4_root.cxx
- get_selected_reference()
: MG_preserves.cxx
- get_selected_SAI()
: SAIs.cxx
- get_selected_species()
: species.cxx
- get_shared_sellist_awar_base()
: AWT_sel_boxes.cxx
- get_shared_sellist_awar_name()
: AWT_sel_boxes.cxx
- get_short()
: names.cxx
- get_shown_advices()
: AW_advice.cxx
- get_sorted_hash_values()
: adhash.cxx
- get_source_and_check_target_tree()
: adtree.cxx
- get_species()
: ali_main.cxx
- get_species_id()
: species.cxx
- get_string()
: mg.cxx
- get_string_cache()
: probe_collection.cxx
- get_suffix()
: AW_file.cxx
- get_taxonomy()
: adlang1.cxx
- get_taxonomy_string()
: adlang1.cxx
- get_token()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- get_token_and_incr_lineno()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- get_tree_behind_idx()
: adtree.cxx
- get_tree_idx()
: adtree.cxx
- get_tree_infrontof_idx()
: adtree.cxx
- get_tree_with_idx()
: adtree.cxx
- get_type()
: probe_tree.h
- get_universe()
: AW_device.cxx
- get_upgroup()
: DI_foundclusters.cxx
- get_upper_lower_cursor_pos()
: ED4_cursor.cxx
- get_user_flags()
: arbdb.cxx
- get_user_matrix()
: DI_matr.cxx
- get_var_string()
: aisc_proto.h
, aisc_var_ref.c
- getAAgroupDefinition()
: chartable.cxx
- getAminoAcidAbbr()
: AP_codon_table.hxx
, AP_codon_table.cxx
- getArbFilter()
: arb_dnarates.cxx
- getAwarName()
: SaiProbeVisualization.cxx
, ED4_visualizeSAI.cxx
- getbasefreqs()
: arb_dnarates.cxx
- getClrDefAwar()
: ED4_visualizeSAI.cxx
- getClusterIndex()
: admalloc.cxx
- getdata()
: arb_dnarates.cxx
- getdecl()
: mkptypes.cxx
- GetDisplayInfo()
: SaiProbeVisualization.cxx
- getDrawGcs()
: GEN_graphic.cxx
- getelem()
: GDE_proto.h
, GDE_arbdb_io.cxx
- getEntropy()
: align.cxx
- getenv_autodirectory()
: adsocket.cxx
- getenv_executable()
: adsocket.cxx
- getenv_existing_directory()
: adsocket.cxx
- getExtension()
: arb_help2xml.cxx
- getFrand()
: frand.h
, frand.c
- getHitInfo()
: db_query.cxx
- gethostname()
: arb_a2ps.c
- getIcon()
: AW_window.cxx
- GetImageFile()
: RNA3D_Textures.cxx
- getinput()
: arb_dnarates.cxx
- getInt()
: arb_probe.cxx
- getKnownMacroClients()
: trackers.cxx
- getLastPtrRef()
: mkptypes.cxx
- GetLine()
: ureadseq.c
- getLocalFlag()
: UnitTester.cxx
- getlogin()
: arb_a2ps.c
- getMacroRecorder()
: trackers.hxx
- getNameOnly()
: xfergui.cxx
- getNumFromStdin()
: arb_primer.cxx
- getnums()
: arb_dnarates.cxx
- getoptions()
: arb_dnarates.cxx
- getparamlist()
: mkptypes.cxx
- getParsedFontPart()
: AW_xfont.cxx
- getPartPositions()
: adali.cxx
- getPenalty()
: ClustalV.cxx
- getrel_GBDATA()
: admap.cxx
- gets_noOverflow()
: gets_noOverflow.h
- getSelectedRule()
: xfergui.cxx
- getSelectedRuleIndex()
: xfergui.cxx
- getSelectedRuleset()
: xfergui.cxx
- getseqtype()
: ureadseq.h
, ureadseq.c
- getSpeciesSortedByBadPositions()
: ED4_detect_bad_ali.cxx
- getStipplePixmap()
: AW_Xm.cxx
- Getstr()
: util.cxx
, prototypes.h
- getString()
: arb_probe.cxx
- getsym()
: mkptypes.cxx
- getToken()
: ad_load.cxx
- getTrnsprob()
: trnsprob.cxx
, trnsprob.h
- getxnode()
: arb_dnarates.cxx
- getxtip()
: arb_dnarates.cxx
- getyspace()
: arb_dnarates.cxx
- GI_importGenomeFile()
: GenomeImport.cxx
, GenomeImport.h
- give_buffer()
: arb_match.cxx
, arbdb.cxx
- GLE_revcomp_cb()
: GEN_interface.cxx
- GLE_update_from_detailFields()
: GEN_interface.cxx
- GLE_update_from_location()
: GEN_interface.cxx
- global_colorgroup_use_changed_cb()
: item_shader.cxx
- global_tree()
: PARS_main.cxx
- global_tree_root()
: PARS_main.cxx
- GLwDrawingAreaMakeCurrent()
: GLwDrawA.c
, GLwDrawA.h
- GLwDrawingAreaSwapBuffers()
: GLwDrawA.h
, GLwDrawA.c
- glwInput()
: GLwDrawA.c
- got_macro_ability()
: trackers.cxx
, macros.hxx
- gotounit()
: AW_file.cxx
- grl_aid()
: group_search.cxx
- grl_dupidx()
: group_search.cxx
- grl_groupsize()
: group_search.cxx
- grl_hitcount()
: group_search.cxx
- grl_hitidx()
: group_search.cxx
- grl_markedingroup()
: group_search.cxx
- grl_nesting()
: group_search.cxx
- group_and_refold_tree()
: TreeCallbacks.cxx
- group_awar_changed_cb()
: NT_extern.cxx
- group_clusters()
: DI_clusters.cxx
- group_is_folded()
: group_search.cxx
- group_mark_cb()
: NT_group_search.cxx
- group_name_changed_cb()
: group_search.cxx
- group_selected_by_canvas_cb()
: NT_extern.cxx
- group_set_folded()
: group_search.cxx
- group_species()
: ED4_no_class.cxx
- group_species_by_field_content()
: ED4_no_class.cxx
- group_species_cb()
: ED4_no_class.cxx
, ed4_class.hxx
- GS_calc_resulting_groupname()
: group_search.h
, group_search.cxx
- gtoe()
: embl.cxx
, prototypes.h
- gtoe_author()
: embl.cxx
- gtoe_journal()
: embl.cxx
- gtoe_reference()
: embl.cxx
- gtom()
: mg.cxx
, prototypes.h
- gxl_groupname()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_ingroup()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_keeled()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_newsize()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_oldsize()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_outgroup()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_penalty()
: NT_tree_cmp.cxx
- gxl_unknown()
: NT_tree_cmp.cxx