- f -

• fa_assert() : seq_search.cxx
• fail_if_error() : arb_sub2ascii.cxx
• fake_AW_init_color_groups() : test_env.h
• FastAligner_create_variables() : fast_aligner.cxx , fast_aligner.hxx
• FastAligner_create_window() : fast_aligner.cxx , fast_aligner.hxx
• FastAligner_delete_temp_entries() : fast_aligner.cxx , fast_aligner.hxx
• FastAligner_set_align_current() : fast_aligner.cxx , fast_aligner.hxx
• FastAligner_set_reference_species() : fast_aligner.cxx , fast_aligner.hxx
• FastAligner_start() : fast_aligner.cxx , fast_aligner.hxx
• fflush() : UnitTester.cxx
• fflush_all() : PT_tools.h
• field_awar() : MG_gene_species.cxx
• field_changed_cb() : AWT_input_mask.cxx
• field_content_changed_cb() : AWT_config_manager.cxx
• field_convert_commit_cb() : ui_species.cxx
• field_convert_update_typesel_cb() : ui_species.cxx
• field_create_cb() : ui_species.cxx
• field_delete_cb() : ui_species.cxx
• fieldContainsAlignment() : MG_species.cxx
• fieldname_changed_cb() : item_sel_list.cxx
• fieldtype_changed_cb() : item_sel_list.cxx
• figi2_() : eispack.cxx
• figi_() : eispack.cxx
• file_exists() : main.cxx
• file_selection_cb() : AW_modal.cxx , aw_window_Xm.hxx
• filename_changed_cb() : MG_main.cxx
• fileOrLink() : AW_file.cxx
• fileselection_filename_changed_cb() : AW_file.cxx
• fileselection_filter_changed_cb() : AW_file.cxx
• fill_boolrules_array_from_AWAR() : saicalc.cxx
• fill_fileselection_cb() : AW_file.cxx
• fill_pam() : ClustalV.cxx
• fill_SAI_group_selection_list() : ad_ext.cxx
• fill_species_name_array() : adtree.cxx
• fill_with_source_sais() : saicalc.cxx
• fillSelNamList() : NT_validManual.cxx
• filter_columnstat_SAIs() : ColumnStat.cxx
• filter_loadable_SAIs() : ED4_no_class.cxx
• filter_posvar_SAI_for_ali() : graph_aligner_gui.cxx
• filter_seq() : adlang1.cxx
• Find() : GDE_ParseMenu.cxx , GDE_proto.h
• Find2() : GDE_ParseMenu.cxx , GDE_proto.h
• find_data_file() : RNA3D_StructureData.cxx
• find_date() : date.cxx
• find_date_long_form() : date.cxx
• find_display_determining_sort_order() : db_query.cxx
• find_family() : PT_family.cxx , pt_prototypes.h
• find_gbdata_offset() : admap.cxx
• find_group_name_entry() : AP_Tree.cxx
• find_hash_entry() : adhash.cxx
• find_internal_name() : AWT_input_mask.cxx
• find_largest_tree() : adtree.cxx
• find_least_deep_leaf() : PARS_main.cxx
• find_macro_in() : adtools.cxx
• find_module() : TestEnvironment.cxx
• find_node_with_groupdata() : Group.cxx
• find_open_close_paren() : arb_proto_2_xsub.cxx
• find_or_create() : adquery.cxx
• find_or_create_error_container() : adtools.cxx
• find_or_createAndRegisterWindow() : AW_window.cxx
• find_pattern() : prototypes.h , util.cxx
• find_pipe_symbol() : ut_valgrinded.h
• find_SAI_by_id() : SAIs.cxx
• find_SAI_candidates() : MG_preserves.cxx
• find_sep() : PT_main.cxx
• find_significant_positions() : ED4_terminal.cxx
• find_species_by_id() : species.cxx
• find_species_candidates() : MG_preserves.cxx
• find_strain() : prototypes.h , util.cxx
• find_sub_by_quark() : adquery.cxx
• find_sub_sub_by_quark() : adquery.cxx
• find_subspecies() : prototypes.h , util.cxx
• findAffectedKeys() : NT_dbrepair.cxx
• findAutomarkingBranchWindow() : NT_branchAnalysis.cxx
• findch() : arb_dnarates.cxx
• findCommand() : AWT_input_mask.cxx
• findItemShader() : item_shader.cxx
• findLeftmostProbe() : PT_findEx.cxx
• findLongestHelix() : SEC_structure.cxx
• findMultipattern() : util.cxx
• findNextProbe() : PT_findEx.cxx
• findNode() : DI_matr.cxx
• findOrCreate_configuration() : ad_config.cxx
• findParentGroup() : NT_taxonomy.cxx
• findPattern() : util.cxx
• findPlugin() : ED4_plugins.cxx
• findSegmentContaining() : SEC_split.cxx
• findSiteRates() : arb_dnarates.cxx
• findStrain() : util.cxx
• findSubspecies() : util.cxx
• findTipName() : arb_dnarates.cxx
• FindType() : GDE_FileIO.cxx
• first_experiment_in_range() : EXP_interface.cxx
• first_gene_in_range() : GEN_interface.cxx
• first_known_enum_value() : adperl.cxx
• first_non_ascii_char() : TreeWrite.cxx
• first_searchkey_changed_cb() : db_query.cxx
• firstChar() : arb_help2xml.cxx
• firstCharOfAwarOrDefault() : saicalc.cxx
• fit_pages() : AWT_canio.cxx
• fit_pages_cb() : AWT_canio.cxx
• fix_aligned_data() : GDE_event.cxx
• fixed_range_offset() : ValueTuple.cxx
• flag_callback() : UnitTester.cxx
• flagDir() : TestEnvironment.cxx
• float_cmp() : arbtools.h
• float_diff_2_cmp() : arbtools.h
• float_shift_factor() : adlang1.cxx
• flush_cache_entry() : adcache.cxx
• flush_taxonomy_cb() : adlang1.cxx
• flush_taxonomy_if_new_group_cb() : adlang1.cxx
• fnextch() : mkptypes.cxx
• fold_line() : arb_a2ps.c
• font_has_fixed_width() : AW_preset.cxx
• fontinfo_awarname() : AW_preset.cxx
• fontname_awarname() : AW_preset.cxx
• fontsize_awarname() : AW_preset.cxx
• force_group_update() : ED4_root.cxx
• force_in_range() : arb_algo.h
• forget_cached_column_stat() : ED4_colStat.cxx
• format() : insdel.cxx , adlang1.cxx
• format2name() : fconv.cxx
• format_to_alilen() : insdel.cxx
• formatstr() : readseq.c
• formatted() : aisc_proto.h , aisc_commands.c
• foundin() : mkptypes.cxx
• fputc() : UnitTester.cxx
• fputs() : UnitTester.cxx
• fputs_len() : util.cxx , prototypes.h
• free_action() : AW_root.cxx
• free_arb_params() : servercntrl.cxx , servercntrl.h
• free_cached_taxonomy() : adlang1.cxx
• free_dtree() : adoptimize.cxx
• free_gbm_table() : admalloc.cxx
• free_hit_description() : db_query.cxx
• free_insDelBuffer() : insdel.cxx
• freeBlock_() : mem.h , mem.cxx
• freeExcludedSymParts() : mkptypes.cxx
• freeFrand() : frand.h , frand.c
• freeGbdByKey() : admap.cxx
• freeIsland() : align.cxx
• freeMatrix_() : mem.cxx , mem.h
• freeRequiredSymParts() : mkptypes.cxx
• freeRNS() : rns.c , rns.h
• freeSpeciesConcatenateList() : NT_concatenate.cxx
• freeSpeciesMergeList() : ED4_no_class.cxx
• freeSpreading() : spreadin.h , spreadin.c
• freeSymParts() : mkptypes.cxx
• freeTree() : arb_dnarates.cxx
• freeTreeNode() : arb_dnarates.cxx
• fts_filesel_changed_cb() : xfergui.cxx
• ftwrite_aligned() : admap.cxx
• ftwrite_unaligned() : admap.cxx
• fullMacroname() : adtools.cxx