- u -

• udata() : probe_tree.h
• unalign() : TranslateRealign.cxx
• unattached_message() : arb_help2xml.cxx
• undefine_branchlengths() : AP_tree_edge.cxx
• undo_entry() : adindex.cxx
• unEscapeString() : adlang1.cxx
• unGetLine() : ureadseq.c
• unifyCluster() : Cma.cxx
• uninitEntropy() : align.cxx
• uninitScore() : align.cxx
• uninitTrnsprob() : trnsprob.cxx , trnsprob.h
• uninstall_SigHandler() : SigHandler.h
• uniqueID() : GDE_HGLfile.cxx , GDE_proto.h
• UNITTEST_sigsegv_handler() : UnitTester.cxx
• unitTesterDir() : TestEnvironment.cxx
• UnknownOption() : mkptypes.cxx
• unlink_awar_from_DB() : AW_root.cxx
• unlink_cache_entry() : adcache.cxx
• unlink_mask_from_database() : AWT_input_mask.cxx
• unlock_detached_cb() : info_window.cxx
• unmark_branches_cb() : NT_branchAnalysis.cxx
• unmark_species() : NT_edconf.cxx
• upcase() : prototypes.h , util.cxx , TestEnvironment.cxx
• update_all() : DI_clusters.cxx
• update_cb() : DI_matr.cxx
• update_ClrTransTabNamesList_cb() : ED4_visualizeSAI.cxx
• update_cluster_group() : DI_clusters.cxx
• update_cluster_sellist() : DI_clusters.cxx
• update_colorset_selection_list() : db_query.cxx
• update_default_treename_cb() : ad_trees.cxx
• update_example() : DI_clusters.cxx
• update_exportTest_result_cb() : AWTI_edit.cxx
• update_extension_size() : ED4_no_class.cxx
• update_filter_cb() : ad_trees.cxx
• update_format_description() : AWTI_import.cxx
• update_format_description_and_suffix() : AWTI_export.cxx
• update_group_folding() : ED4_no_class.cxx
• update_HelixNrDispList() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx
• update_import_filename_cb() : AWTI_edit.cxx
• update_location_from_GEN_position() : GEN_interface.cxx
• update_macro_record_button() : macro_gui.cxx
• update_main_window_title() : NT_extern.cxx
• update_min_mutations() : AP_seq_protein.cxx
• update_on_config_change_cb() : PH_filt.cxx
• update_ptserver_button() : AWT_sel_boxes.cxx
• update_random_repeat() : PARS_main.cxx
• update_RangeList() : NT_ins_col.cxx
• update_RangeList_cb() : NT_ins_col.cxx
• update_rectangle() : ED4_window.cxx
• update_reference_settings() : ED4_seq_colors.cxx
• update_restore_label() : DI_clusters.cxx
• update_rulesAwar() : saicalc.cxx
• update_scrolled_rectangles() : ED4_manager.cxx
• update_undefined_leaf_branchlength() : AP_tree_edge.cxx
• updateChangedInputFields() : xfergui.cxx
• updateEntropy() : align.cxx
• updateScore() : align.cxx
• updateTrnsprob() : trnsprob.cxx , trnsprob.h
• updateValNameList() : NT_validManual.cxx
• uppercase() : arb_dnarates.cxx
• uprootTree() : arb_dnarates.cxx
• url_host_matches() : AWT_www.cxx
• usage() : names.cxx
• Usage() : mkptypes.cxx
• usage() : arb_a2ps.c , readseq.c
• use_editor_range_cb() : NT_split_ali.cxx
• use_other_path_buf() : adsocket.cxx
• use_selected_as_target_cb() : ad_trees.cxx , saicalc.cxx
• user_code_nr_changed_cb() : AP_pro_a_nucs.cxx
• useSelectedAlignment() : NT_concatenate.cxx