- i -
- identify_gb_item()
: adlang1.cxx
- identity()
: trnsprob.cxx
- idx2dna()
: AP_codon_table.cxx
- idx2side()
: AP_tree_nlen.cxx
- ignore_arb_prop()
: AW_root.cxx
- imemerr()
: admalloc.cxx
- import_and_continue_cb()
: AWTI_import.cxx
- import_file_changed_cb()
: AWTI_edit.cxx
- import_structure_from_file()
: SEC_main.cxx
- import_window_close_cb()
: AWTI_import.cxx
- importerWarning()
: DBwriter.cxx
- imtql1_()
: eispack.cxx
- imtql2_()
: eispack.cxx
- imtqlv_()
: eispack.cxx
- inc_insert_progress()
: CT_dtree.cxx
- inch2mm()
: AWT_canio.cxx
- indentTo()
: TreeWrite.cxx
- index2level()
: ED4_objspec.cxx
- INDEX_DICT_OFFSET()
: adoptimize.cxx
- info2bio()
: arb_defs.h
- init()
: DI_matr.cxx
- init_Advisor()
: AW_advice.cxx
, aw_advice.hxx
- init_alignments()
: MG_preserves.cxx
- init_bond_matrix()
: PT_extern.c
- init_buffer()
: arbdb.cxx
- init_config_admin_awars()
: NT_edconf.cxx
- init_config_awars()
: NT_edconf.cxx
- init_data()
: db_server.cxx
- init_file_printing()
: arb_a2ps.c
- init_flag_awars()
: ED4_flags.cxx
- init_gene_species_xfer_fields_config()
: MG_gene_species.cxx
- init_gene_species_xfer_fields_subconfig()
: MG_gene_species.cxx
- init_gpp()
: adali.cxx
- init_indices_and_count_sons()
: adseqcompr.cxx
- init_itemspecific_DBUI_awars()
: ui_species.cxx
- init_itemType_specific_window()
: items.h
, itemtools.cxx
- init_local_com_struct()
: probe_design.cxx
, arb_probe.cxx
- init_myers()
: ClustalV.cxx
- init_preserve_awars()
: MG_preserves.cxx
- init_rule_definition_awars()
: xfergui.cxx
- init_show_pair()
: ClustalV.cxx
- init_static()
: probe_tree.h
- init_system3_tab()
: MP_noclass.cxx
- init_tmp_branch()
: ad_load.cxx
- initBaseLookups()
: base.c
, base.h
- initBaseSpecificProbs()
: rns.c
- InitCallBacks()
: RNA3D_Interface.cxx
- initEntropy()
: align.cxx
- initExtensions()
: RNA3D_OpenGLEngine.cxx
- initFrand()
: frand.c
, frand.h
- Initialize()
: GLwDrawA.c
- initialize_IUPAC_add()
: iupac.cxx
- InitializeOpenGLEngine()
: RNA3D_OpenGLEngine.cxx
, RNA3D_OpenGLEngine.hxx
- InitializeOpenGLWindow()
: RNA3D_OpenGLEngine.cxx
, RNA3D_OpenGLEngine.hxx
- InitNASeq()
: GDE_FileIO.cxx
, GDE_proto.h
- initrav()
: arb_dnarates.cxx
- initScore()
: align.cxx
- initTrnsprob()
: trnsprob.cxx
, trnsprob.h
- initXferAwars()
: xfergui.cxx
- inject_STDIN()
: phylip.cxx
- input_cb()
: DI_view_matrix.cxx
, AW_modal.cxx
, aw_window_Xm.hxx
- input_event()
: AWT_canvas.cxx
- input_history_cb()
: AW_modal.cxx
, aw_window_Xm.hxx
- input_history_insert()
: AW_modal.cxx
- inputCharsetChanged_cb()
: saicalc.cxx
- inputMaskDir()
: AWT_input_mask.cxx
- inputMaskFullname()
: AWT_input_mask.cxx
- inputweights()
: arb_dnarates.cxx
- ins_ntree()
: CT_ntree.cxx
- insdel_event()
: NT_ins_col.cxx
- insdel_sai_event()
: NT_ins_col.cxx
- insert_all_species_into_tree()
: PARS_main.cxx
- insert_at()
: insdel.cxx
- insert_color_collapse_submenu()
: TreeCallbacks.cxx
- insert_fieldtype_toggles()
: ui_species.cxx
- insert_gap()
: insdel.cxx
- insert_genes_of_organism()
: arb_gene_probe.cxx
- insert_interruption_to_macro_cb()
: macro_gui.cxx
- insert_macro_menu_entry()
: macro_gui.cxx
, macros.hxx
- insert_mark_topic()
: TreeCallbacks.cxx
- insert_mark_topics()
: TreeCallbacks.cxx
- insert_new_species_terminal()
: ED4_cursor.cxx
- insert_ntree()
: CT_ntree.cxx
, CT_ntree.hxx
- insert_search_fields()
: ED4_root.cxx
- insert_section_header()
: TreeDisplay.cxx
- insert_species_into_tree()
: PARS_main.cxx
- insertAligned()
: fast_aligner.cxx
- insertBase()
: fast_aligner.cxx
- insertClustalValigned()
: fast_aligner.cxx
- InsertDatainGDE()
: GDE_arbdb_io.cxx
- insertGap()
: fast_aligner.cxx
- insertionOrder_less()
: CT_hash.cxx
- insertShapeSelection()
: RNA3D_Interface.cxx
- insertSlaveBases()
: fast_aligner.cxx
- insertsToNextBase()
: fast_aligner.cxx
- install_config_change_callbacks()
: NT_edconf.cxx
- install_SigHandler()
: SigHandler.h
- intersection()
: pos_range.h
- INVALID_CB_PARAM_TYPE()
: cbtypes.h
- invalid_use_in_server()
: adcomm.cxx
- invit_()
: eispack.cxx
- ipol()
: trnsprob.cxx
- is_abbrev_switch()
: main.cxx
- is_absolute_path()
: adsocket.cxx
- is_ali_gap()
: seq_search.hxx
- is_ambig_base()
: probe.h
- is_binary_db_id()
: ad_load.cxx
- is_binaryfile()
: arb_a2ps.c
- is_cached_taxonomy()
: adlang1.cxx
- is_chain()
: probe_tree.h
- is_char()
: arb_dnarates.cxx
- is_cluster()
: DI_clusters.cxx
- is_comment()
: recmac.cxx
- is_consensus_gap()
: ED4_cursor.cxx
- is_cursor_keycode()
: TreeDisplay.cxx
- is_default_or_ignore_sighandler()
: SigHandler.h
- is_dynamic()
: AWTI_import.cxx
- is_embl_comment()
: embl.cxx
- is_empty_code()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- is_end_mark()
: global.h
- is_end_of_macro()
: recmac.cxx
- is_EOL()
: BufferedFileReader.cxx
- is_EOS()
: aisc_inline.h
- is_escaped()
: Importer.cxx
- is_forward_decl()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- is_Gap()
: RNA3D_StructureData.cxx
, BI_basepos.cxx
- is_gap()
: seq_search.hxx
- is_gapchar()
: global.h
- is_genbank_date()
: date.cxx
- is_help_req()
: main.cxx
- is_hidden_file()
: AWTI_import.cxx
- is_ID_char()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- is_in_buffer()
: arbdb.cxx
- is_in_EXPERIMENT_path()
: changekey.cxx
- is_in_GENE_path()
: changekey.cxx
- is_in_reserved_path()
: changekey.cxx
- is_inf()
: arbtools.h
- is_info()
: xfergui.cxx
- is_input_format()
: fun.h
- is_leaf()
: probe_tree.h
- is_LF()
: aisc_inline.h
- is_LF_EOS()
: aisc_inline.h
- is_list_style()
: TreeDisplay.hxx
- is_marked_as_default_len()
: TreeRead.h
- is_name_of_envvar()
: adsocket.cxx
- is_named()
: ED4_root.cxx
- is_nan()
: arbtools.h
- is_nan_or_inf()
: arbtools.h
- is_node()
: probe_tree.h
- is_normal()
: arbtools.h
- is_prefined()
: AWT_config_manager.cxx
- is_prototype()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- is_pseudo_key()
: db_query.cxx
- is_resize_event()
: AW_window.cxx
- is_SAI_named()
: ED4_root.cxx
- is_saved()
: probe_tree.h
- is_SEP()
: aisc_inline.h
- is_SEP_LF_EOS()
: aisc_inline.h
- is_sequence_terminator()
: global.h
- is_similar()
: CT_part.hxx
- is_SPACE()
: aisc_inline.h
- is_SPACE_LF()
: aisc_inline.h
- is_SPACE_LF_EOS()
: aisc_inline.h
- is_SPACE_SEP_LF_EOS()
: aisc_inline.h
- is_species_named()
: ED4_root.cxx
- is_startof_itemlist_element()
: arb_help2xml.cxx
- is_std_base()
: probe.h
- is_std_base_or_N()
: probe.h
- is_tree()
: adtree.cxx
- is_tree_style()
: TreeDisplay.hxx
- is_type_word()
: mkptypes.cxx
- is_typedef()
: arb_proto_2_xsub.cxx
- is_valid_base()
: probe.h
- is_word_char()
: global.h
- isAnyChar()
: ureadseq.c
- isCorrectParent()
: group_search.cxx
- isdatenum()
: date.cxx
- isElement()
: probe_collection.cxx
- isEmptyOrComment()
: arb_help2xml.cxx
- isGap()
: AP_codon_table.cxx
, AP_seq_protein.cxx
, TranslateRealign.cxx
- isgap()
: GDE_event.cxx
- isGap()
: AP_seq_dna.cxx
- isInternalMaskName()
: AWT_input_mask.cxx
- isKeyword()
: AWT_input_mask.cxx
- isMackeHeader()
: macke.h
- isMackeNonSeq()
: macke.h
- isMackeSeqHeader()
: macke.h
- isMackeSeqInfo()
: macke.h
- ismonth()
: date.cxx
- isQuoteChar()
: TreeWrite.cxx
- isSeqChar()
: ureadseq.c
- isSeqNumChar()
: ureadseq.c
- isSignificant()
: align.cxx
- isStartOrStopCodonNr()
: AP_codon_table.cxx
- isTU()
: GDE_event.cxx
- isUnique()
: align.cxx
- isWhite()
: arb_help2xml.cxx
- item_changed_cb()
: AWT_input_mask.cxx
- itemAwar()
: ui_species.cxx
- itemTypeSpecificWindowID()
: itemtools.cxx
- iterate()
: arb_perf_test.cxx
- itobase36()
: arb_dnarates.cxx