- e -

• E4B_IMPL_CASTOP() : ed4_class.hxx
• eat_para_separator() : AWT_input_mask.cxx
• eatgaps() : GDE_event.cxx
• eatWhite() : arb_help2xml.cxx
• ecolipos2int() : probe_design.cxx
• ED4_activate_col_stat() : ed4_colStat.hxx , ED4_colStat.cxx
• ED4_alignment_length_changed() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ed4_bind_mainDB_awar_callbacks() : ED4_main.cxx
• ed4_bp_sequence_changed_cb() : ED4_cursor.cxx
• ED4_build_group_manager_end() : ED4_base.cxx , ed4_class.hxx
• ED4_build_group_manager_start() : ED4_base.cxx , ed4_class.hxx
• ED4_calc_terminal_extentions() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_change_cursor() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ed4_change_edit_mode() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ed4_changesecurity() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_clear_stored_curpos() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_compression_changed_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_compression_toggle_changed_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_configure_species_flags() : ED4_flags.cxx , ed4_flags.hxx
• ED4_consensus_definition_changed() : ed4_class.hxx , ED4_consensus.cxx
• ED4_consensus_display_changed() : ed4_class.hxx , ED4_consensus.cxx
• ED4_correctBlocktypeAfterModification() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ed4_create_all_awars() : ED4_main.cxx
• ED4_create_consensus_awars() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_create_consensus_definition_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_create_detect_bad_alignment_awars() : ED4_detect_bad_ali.cxx , ed4_detect_bad_ali.hxx
• ED4_create_dot_missing_bases_awars() : ED4_dots.cxx , ed4_dots.hxx
• ED4_create_editor_options_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_create_faligner_window() : ED4_root.cxx
• ED4_create_group_species_by_field_window() : ed4_class.hxx
• ED4_create_loadConfiguration_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_create_loadSAI_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ed4_create_mainDB_awars() : ED4_main.cxx
• ED4_create_modsai_window() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_create_NDS_awars() : ED4_nds.cxx , ed4_nds.hxx
• ED4_create_nds_window() : ED4_nds.cxx , ed4_nds.hxx
• ED4_create_new_seq_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_create_replace_window() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_create_saveConfigurationAs_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_create_search_awars() : ED4_search.cxx , ed4_search.hxx
• ED4_create_seq_colors_window() : ED4_seq_colors.cxx , ed4_seq_colors.hxx
• ED4_create_sequences_for_gde() : ED4_main.cxx
• ED4_create_viewDifferences_window() : ED4_seq_colors.cxx , ed4_seq_colors.hxx
• ED4_CreateProteinViewer_window() : ED4_ProteinViewer.cxx , ed4_ProteinViewer.hxx
• ED4_createVisualizeSAI_Awars() : ED4_visualizeSAI.cxx , ed4_visualizeSAI.hxx
• ED4_createVisualizeSAI_window() : ED4_visualizeSAI.cxx , ed4_visualizeSAI.hxx
• ED4_delete_temp_entries() : ED4_root.cxx
• ED4_disable_col_stat() : ED4_colStat.cxx , ed4_colStat.hxx
• ED4_edit_direction_changed() : ED4_main.cxx
• ED4_encodeSearchDescriptor() : ed4_search.hxx
• ED4_exit() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_expose_cb() : ED4_window.cxx
• ED4_find_MoreSequences_manager() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_find_SAI_name_terminal() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ED4_find_species_name_terminal() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ED4_find_species_or_SAI_name_terminal() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ED4_finish_and_show_notFoundMessage() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_gap_chars_changed() : ED4_main.cxx
• ED4_get_aligner_data_access() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ED4_get_and_jump_to_current() : ED4_cursor.cxx , ed4_class.hxx
• ED4_get_and_jump_to_selected_SAI() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_get_and_jump_to_species() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_get_edit_mode() : ED4_no_class.cxx
• ED4_get_highlighted_range() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_get_marked_from_menu() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_get_NDS_text() : ED4_nds.cxx , ed4_nds.hxx
• ED4_get_NDS_width() : ED4_nds.cxx , ed4_nds.hxx
• ED4_getBlocktype() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_getSaiColorString() : ED4_visualizeSAI.cxx , ed4_visualizeSAI.hxx
• ED4_helix_jump_opposite() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_horizontal_change_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_init_notFoundMessage() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_input_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_is_gap_character() : ed4_edit_string.hxx
• ED4_jump_to_current_species() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_jump_to_cursor_position() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_load_new_config() : ED4_no_class.cxx
• ED4_mark_matching_species() : ED4_search.cxx
• ED4_menu_highlight() : ED4_root.cxx
• ED4_menu_perform_block_operation() : ED4_root.cxx
• ED4_motion_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ed4_nds_select_change() : ED4_nds.cxx
• ED4_new_editor_window() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_no_dangerous_modes() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ED4_perform_block_operation() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_pfold_calculate_secstruct_match() : ED4_protein_2nd_structure.cxx , ed4_protein_2nd_structure.hxx
• ED4_pfold_create_props_window() : ED4_protein_2nd_structure.cxx , ed4_protein_2nd_structure.hxx
• ED4_pfold_extend_nucleation_sites() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_find_nucleation_sites() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_find_turns() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_init_statics() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_predict_structure() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_resolve_overlaps() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_round_sym() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_select_SAI_and_update_option_menu() : ED4_protein_2nd_structure.cxx
• ED4_pfold_set_SAI() : ED4_protein_2nd_structure.cxx , ed4_protein_2nd_structure.hxx
• ED4_popup_detect_bad_alignment_window() : ED4_detect_bad_ali.cxx , ed4_detect_bad_ali.hxx
• ED4_popup_dot_missing_bases_window() : ED4_dots.cxx , ed4_dots.hxx
• ED4_popup_gc_window() : ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• ED4_popup_helix_or_pfold_window() : ED4_root.cxx
• ED4_popup_search_window() : ED4_search.cxx , ed4_search.hxx
• ED4_postcbcb() : ED4_main.cxx
• ED4_quit_editor() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_reloadConfiguration() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_remote_event() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_remote_set_cursor_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_remove_faligner_entries() : ED4_root.cxx
• ED4_repeat_last_search() : ED4_search.cxx , ed4_search.hxx
• ED4_request_full_instant_refresh() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_request_full_refresh() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_request_relayout() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_resize_all_extensions() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_resize_cb() : ED4_window.cxx
• ED4_restore_curpos() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_save_properties() : ED4_root.cxx
• ED4_saveConfiguration() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ed4_scroll() : ED4_no_class.cxx
• ED4_scrollbar_change_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_search_cb() : ED4_search.cxx , ed4_search.hxx
• ED4_selected_SAI_changed_cb() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_selected_species_changed_cb() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_set_clipping_rectangle() : ED4_tools.cxx , ed4_tools.hxx
• ED4_set_col_stat_threshold() : ED4_colStat.cxx , ed4_colStat.hxx
• ED4_set_helixnr() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_set_iupac() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_set_protection() : ED4_root.cxx
• ED4_setBlocktype() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_setColumnblockCorner() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_setup_gaps_and_alitype() : ed4_edit_string.hxx , ED4_main.cxx
• ED4_show_helix_on_device() : ED4_text_terminals.cxx
• ED4_show_protein_match_on_device() : ED4_text_terminals.cxx
• ED4_start_editor_on_configuration() : ED4_no_class.cxx
• ED4_start_plugin() : ED4_plugins.cxx
• ED4_store_curpos() : ed4_class.hxx , ED4_cursor.cxx
• ED4_timer() : ED4_no_class.cxx
• ED4_toggle_block_type() : ED4_block.cxx , ed4_block.hxx
• ED4_toggle_detailed_column_stats() : ed4_colStat.hxx , ED4_colStat.cxx
• ED4_toggle_viewDifferences() : ED4_seq_colors.cxx , ed4_seq_colors.hxx
• ED4_trigger_instant_refresh() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_undo_redo() : ED4_root.cxx
• ED4_vertical_change_cb() : ed4_class.hxx , ED4_no_class.cxx
• ED4_viewDifferences_announceTerminalChange() : ed4_seq_colors.hxx , ED4_seq_colors.cxx
• ED4_viewDifferences_disable() : ED4_seq_colors.cxx , ed4_seq_colors.hxx
• ED4_viewDifferences_setNewReference() : ed4_seq_colors.hxx , ED4_seq_colors.cxx
• ED4_with_all_edit_windows() : ed4_class.hxx , ED4_main.cxx
• ED4_with_all_loaded_species() : ED4_root.cxx
• ED4_with_whole_block() : ED4_block.cxx
• ED4_zoom_message_window() : ED4_root.cxx
• ed_calltexe_event() : AWTC_submission.cxx
• ed_rehash_mapping() : AWT_map_key.cxx
• ed_save_var_to_file() : AWTC_submission.cxx
• ed_submit_gen_event() : AWTC_submission.cxx
• ed_submit_info_event() : AWTC_submission.cxx
• ed_submit_info_event_rm() : AWTC_submission.cxx
• ed_submit_parse_event() : AWTC_submission.cxx
• edges_2_leafs() : arbdbt.h
• edges_2_nodes() : arbdbt.h
• edit_cb() : AWT_config_manager.cxx
• edit_macro_cb() : macro_gui.cxx
• edit_SAI_description() : ad_ext.cxx
• editRuleset_cb() : xfergui.cxx
• elementHasName() : probe_collection.cxx
• elemOr() : GEN_interface.cxx
• elmbak_() : eispack.cxx
• elmhes_() : eispack.cxx
• eltran_() : eispack.cxx
• embl_comments() : embl.cxx
• embl_continue_line() : embl.cxx
• embl_correct_title() : embl.cxx
• embl_date() : embl.cxx
• embl_key_word() : embl.cxx , prototypes.h
• embl_one_comment_entry() : embl.cxx
• embl_one_entry() : embl.cxx
• embl_origin() : embl.cxx
• embl_out() : embl.cxx , prototypes.h
• embl_out_comments() : embl.cxx
• embl_out_header() : embl.cxx , prototypes.h
• embl_out_origin() : embl.cxx
• embl_print_comment_if_content() : embl.cxx
• embl_print_completeness() : embl.cxx
• embl_print_lines() : embl.cxx
• embl_print_lines_if_content() : embl.cxx
• embl_skip_unidentified() : embl.cxx
• embl_to_gcg() : gcg.cxx
• emit() : mkptypes.cxx
• empiricalfreqs() : arb_dnarates.cxx
• empty_as_none() : graph_aligner_gui.cxx
• enable_auto_match_cb() : probe_design.cxx
• encode_escaped_chars() : AWTI_import.cxx
• encodeBase() : trnsprob.h , trnsprob.cxx
• encodeEntities() : xml.cxx
• endEMBL() : ureadseq.c
• endFitch() : ureadseq.c
• endGB() : ureadseq.c
• endIG() : ureadseq.c
• endNBRF() : ureadseq.c
• endpage() : arb_a2ps.c
• endPearson() : ureadseq.c
• endPhylipSequential() : ureadseq.c
• endPIR() : ureadseq.c
• endStrider() : ureadseq.c
• endsWith() : arb_stdstr.h
• endZuker() : ureadseq.c
• ensure_buffer() : ED4_text_terminals.cxx
• ensure_trees_have_order() : adtree.cxx
• enter_stage_1_build_tree() : PT_buildtree.cxx , pt_prototypes.h
• enter_stage_2_load_tree() : PT_buildtree.cxx , pt_prototypes.h
• entry_is_linked() : adcache.cxx
• entryType() : AW_file.cxx
• enum_check() : ttypes.h
• enum_check_SIGNED() : ttypes.h
• epslon_() : eispack.cxx
• erase_comment_cb() : AWT_config_manager.cxx
• erase_formatter() : PT_new_design.cxx
• erralert() : readseq.c
• error() : defines.c , mkptypes.cxx , defines.h , GLwDrawA.c
• error_with_dbentry() : arbdb.cxx
• error_with_usage() : arb_write_tree_comment.cxx , arb_read_tree.cxx
• errorAt() : mkptypes.cxx
• errorf() : mkptypes.cxx , defines.c , defines.h
• escapeString() : adlang1.cxx
• estimate_loops() : arb_perf_test.cxx
• estimate_stage1_memusage_kb() : PT_partition.h
• etog() : embl.cxx , prototypes.h
• etog_author() : embl.cxx
• etog_convert_references() : embl.cxx
• etog_journal() : embl.cxx
• etom() : prototypes.h , embl.cxx
• evaluate() : arb_dnarates.cxx
• exec_macro_cb() : macro_gui.cxx
• execute() : arb_probe.cxx
• execute_guarded() : UnitTester.cxx , UnitTester.hxx
• execute_guarded_ClientCode() : UnitTester.cxx
• execute_macro() : macros.hxx , macro_gui.cxx
• executeKeystroke() : ED4_no_class.cxx
• EXISTING_GBCONTAINER_ELEM() : gb_header.h
• existingPixmap() : AW_window.cxx
• exit_from_merge() : NT_main.cxx
• exit_myers() : ClustalV.cxx
• exit_removal() : adsocket.cxx
• exit_remove_file() : adsocket.cxx
• exit_show_pair() : ClustalV.cxx
• EXP_create_awars() : EXP_main.cxx , EXP.hxx
• EXP_create_experiment_query_window() : EXP_interface.cxx , EXP.hxx
• EXP_create_experiments_submenu() : EXP_main.cxx , EXP.hxx
• EXP_create_field_items() : EXP_interface.cxx
• EXP_create_mask_submenu() : EXP_main.cxx
• EXP_find_experiment() : adExperiment.cxx , ad_prot.h
• EXP_find_experiment_by_id() : EXP_interface.cxx
• EXP_find_experiment_rel_exp_data() : ad_prot.h , adExperiment.cxx
• EXP_find_or_create_experiment_rel_exp_data() : adExperiment.cxx , ad_prot.h
• EXP_first_experiment_rel_exp_data() : ad_prot.h , adExperiment.cxx
• EXP_get_current_experiment() : EXP_interface.cxx
• EXP_get_experiment_data() : adExperiment.cxx , ad_prot.h
• EXP_get_experiment_id() : EXP_interface.cxx
• EXP_get_first_experiment_data() : EXP_interface.cxx
• EXP_get_next_experiment_data() : EXP_interface.cxx
• EXP_get_selector() : EXP_interface.cxx , EXP.hxx
• EXP_next_experiment() : ad_prot.h , adExperiment.cxx
• EXP_open_mask_window() : EXP_main.cxx
• EXP_popup_experiment_window() : EXP_interface.cxx , EXP_local.hxx
• exp_restore_old_species_marks() : EXP_interface.cxx
• EXP_select_experiment() : EXP_interface.cxx
• EXP_update_combined_cb() : EXP_main.cxx
• expand_all_cb() : TreeCallbacks.cxx
• expand_color_cb() : TreeCallbacks.cxx
• expand_symbolic_directories() : AW_file.cxx
• expand_unmarked_cb() : TreeCallbacks.cxx
• expand_zombies_cb() : TreeCallbacks.cxx
• expandBranches() : adoptimize.cxx
• expandMore() : AP_codon_table.cxx
• expandSetVariables() : AWTI_import.cxx
• expect_entry() : PT_io.cxx
• expect_species_selected() : ui_species.cxx
• expect_used_in_genome_db() : adlang1.cxx
• expectContent() : SEC_main.cxx
• expectedError() : SEC_main.cxx
• expectField() : NT_dbrepair.cxx
• expectToken() : SEC_main.cxx
• experiment_copy_cb() : EXP_interface.cxx
• experiment_copy_handler() : EXP_interface.cxx
• experiment_create_cb() : EXP_interface.cxx
• experiment_create_handler() : EXP_interface.cxx
• experiment_delete_cb() : EXP_interface.cxx
• experiment_field_selection_list_rescan() : changekey.cxx
• experiment_field_selection_list_unhide_all_cb() : changekey.cxx , item_sel_list.h
• experiment_field_selection_list_update_cb() : item_sel_list.h , changekey.cxx
• experiment_rename_cb() : EXP_interface.cxx
• experiment_rename_handler() : EXP_interface.cxx
• expert_mode_changed_cb() : NT_extern.cxx
• explicit_scroll_sync_cb() : NT_sync_scroll.cxx
• export_filename_changed_cb() : AWTI_export.cxx
• export_format_multiple() : seq_export.cxx
• export_format_single() : seq_export.cxx
• export_go_cb() : AWTI_export.cxx
• export_nds_cb() : NT_extern.cxx
• export_newick() : arb_export_newick.cxx
• export_seq_data() : arb_export_seq_filtered.cxx
• export_species_using_form() : seq_export.cxx
• export_structure_to_file() : SEC_main.cxx
• export_to_DB() : GDE_event.cxx
• export_tree_label() : TreeWrite.cxx
• export_tree_node_print() : TreeWrite.cxx
• export_tree_node_print_remove() : TreeWrite.cxx
• export_tree_node_print_xml() : TreeWrite.cxx
• export_tree_rek() : TreeWrite.cxx
• export_write_species() : seq_export.cxx
• exported_sequence() : seq_export.cxx
• exportImportLinkChanged_cb() : AWTI_edit.cxx
• expose_cb() : phwin.hxx , PH_main.cxx
• ExposeOpenGLWindow() : RNA3D_Interface.cxx
• extended_rename_cb() : MG_extendeds.cxx
• extended_rename_handler() : MG_extendeds.cxx
• extract_url_host() : AWT_www.cxx
• extractKeyword() : arb_help2xml.cxx