- d -

• d_sign() : d_sign.cxx
• dated_info() : adstring.cxx
• DB_create_byte_field() : DBwriter.cxx
• DB_create_container() : DBwriter.cxx
• DB_create_string_field() : DBwriter.cxx
• db_updated_cb() : AW_global_awars.cxx
• dbserver_container() : db_server.cxx
• dbserver_entry() : db_server.cxx
• decide_passes_to_use() : PT_buildtree.cxx
• DECL_FUNDA_TYPE() : ttypes.h
• DECL_FUNDA_TYPE_SIGNED() : ttypes.h
• declare_awar_global() : AW_global_awars.cxx
• DECLARE_CBTYPE_FFV_AND_BUILDERS() : cb.h , aw_inotify.hxx
• DECLARE_CBTYPE_FVF_AND_BUILDERS() : cb.h
• DECLARE_CBTYPE_FVV_AND_BUILDERS() : GEN_map.cxx , cb.h , group_search.h , TreeDisplay.hxx , aw_preset.hxx , awt_config_manager.hxx , awt_prompt.hxx , awt_sel_boxes.hxx , DI_clusters.cxx , ed4_class.hxx , ED4_root.cxx
• DECLARE_CBTYPE_VV_AND_BUILDERS() : awt_config_manager.hxx
• decodeBase() : trnsprob.cxx , trnsprob.h
• decodeEscapes() : AWT_input_mask.cxx
• decodeFrand() : simcfg.c
• decodeInt() : simcfg.c
• decodeProb() : simcfg.c
• decodeSearchDescriptor() : ED4_search.cxx
• decr_displ() : ClustalV.cxx
• def_assert() : defines.c , defines.h
• def_outOfMemory() : defines.c , defines.h
• default_characters() : ED4_seq_colors.cxx
• default_color() : ED4_seq_colors.cxx
• default_colorgroup_name() : AW_preset.cxx
• DefaultAlphaCallback() : glpng.c
• DEFINE_ITERATORS() : MetaInfo.cxx , types.h , Location.cxx
• DEFINE_NAMED_ITERATORS() : types.h
• del_boolrule_cb() : saicalc.cxx
• del_reference_cb() : MG_preserves.cxx
• del_rule_cb() : xfergui.cxx
• del_short() : names.cxx
• del_tree() : CT_ntree.cxx
• delete_ali_cb() : AdminGui.cxx
• delete_cb() : AWT_config_manager.cxx
• delete_clusters() : DI_clusters.cxx
• delete_field_cb() : AWT_config_manager.cxx
• delete_from() : insdel.cxx
• delete_from_list() : adhash.cxx
• delete_g_b_undo_entry() : adindex.cxx
• delete_g_b_undo_header() : adindex.cxx
• delete_g_b_undo_list() : adindex.cxx
• delete_gb_dictionary() : adsystem.cxx
• delete_kept_ghostnodes() : PARS_main.cxx
• delete_listed_groups_cb() : NT_group_search.cxx
• delete_macro_cb() : macro_gui.cxx
• delete_queried_species_cb() : db_query.cxx
• delete_SAI_cb() : ad_ext.cxx
• delete_selected_cluster() : DI_clusters.cxx
• delete_selected_group_cb() : NT_group_search.cxx
• delete_unused_changekeys() : changekey.cxx
• deleteColorTranslationTable() : ED4_visualizeSAI.cxx
• deleteDataOfKey() : NT_dbrepair.cxx
• deleteRuleset_cb() : xfergui.cxx
• deleteSuperfluousQuicksaves() : ad_save_load.cxx
• demangle_backtrace() : arb_backtrace.h
• deselectRule() : xfergui.cxx
• Destroy() : GLwDrawA.c
• destroy() : TreeNode.h
• destroy_AW_root() : AW_root.cxx
• destroy_awar() : AW_window.cxx
• destroy_AWT_configuration() : AWT_config_manager.cxx
• destroy_ColumnQualityInfo() : ST_quality.cxx
• destroy_TreeAwarRegistry() : AWT_TreeAwars.cxx
• destroyEdge() : ap_main.hxx
• destroyKeptQueries() : db_query.cxx
• detach_selected_item_cb() : info_window.cxx
• detect_bitmap_size() : AW_button.cxx
• detect_current_ref_terminal() : ED4_seq_colors.cxx
• detect_format_props() : PT_match.cxx
• detect_input_format_cb() : AWTI_import.cxx
• detect_sina_version() : graph_aligner_gui.cxx
• detectArgType() : NT_main.cxx
• detectBrowserCommand() : AW_file.cxx
• detectEqualRowsAndColumns() : saicalc.cxx
• detectLineEnumType() : arb_help2xml.cxx
• detectLinkType() : arb_help2xml.cxx
• detectMaxNameLength() : db_query.cxx
• detectProperties() : ED4_root.cxx
• develDocPath() : AW_help.cxx
• di_autodetect_callback() : DI_matr.cxx
• di_bind_dist_awars() : DI_view_matrix.cxx
• di_calculate_compressed_matrix_cb() : DI_matr.cxx
• di_calculate_full_matrix_cb() : DI_matr.cxx
• di_calculate_matrix() : DI_matr.cxx
• di_calculate_tree_cb() : DI_matr.cxx
• DI_create_cluster_awars() : di_clusters.hxx , DI_clusters.cxx
• DI_create_cluster_detection_window() : DI_clusters.cxx , di_clusters.hxx
• DI_create_matrix_variables() : DI_matr.cxx , DI_main.cxx
• DI_create_matrix_window() : DI_main.cxx , DI_matr.cxx
• DI_create_save_matrix_window() : DI_matr.cxx , di_matr.hxx
• DI_create_view_matrix_window() : DI_view_matrix.cxx , di_view_matrix.hxx
• di_define_compression_tree_name_cb() : DI_matr.cxx
• di_define_save_tree_name_cb() : DI_matr.cxx
• di_define_sort_tree_name_cb() : DI_matr.cxx
• di_exit() : DI_matr.cxx
• di_forget_global_data() : DI_clusters.cxx
• di_mark_by_distance() : DI_matr.cxx
• di_recalc_matrix() : DI_matr.cxx
• di_save_matrix_cb() : DI_matr.cxx
• DI_timer() : DI_main.cxx
• di_view_matrix_cb() : DI_matr.cxx
• di_view_set_distances() : DI_view_matrix.cxx
• di_view_set_max_dist() : DI_view_matrix.cxx
• did_valgrinded_syscall() : UnitTester.cxx
• die() : adperl.cxx
• diff() : ClustalV.cxx
• diff_setting_changed_cb() : ED4_seq_colors.cxx
• diff_smaller_epsilon() : CT_part.hxx
• diff_type_changed_cb() : ED4_seq_colors.cxx
• digit() : arb_dnarates.cxx
• digits() : NT_split_ali.cxx
• disable_advice() : AW_advice.cxx
• disable_test_export() : AWTI_edit.cxx
• disable_test_import() : AWTI_edit.cxx
• discrete_value() : TreeDisplay.cxx
• disexpectField() : NT_dbrepair.cxx
• display_selected_item_cb() : info_window.cxx
• display_selected_rule_cb() : saicalc.cxx
• display_status_cb() : PH_display.cxx , phwin.hxx
• DisplayHelixNrsChanged_CB() : RNA3D_OpenGLEngine.hxx , RNA3D_OpenGLEngine.cxx
• DisplayMoleculeMask() : RNA3D_Interface.cxx
• DisplayPostionsIntervalChanged_CB() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx , RNA3D_OpenGLEngine.hxx
• displays_config_markers() : NT_edconf.cxx
• displays_probeColl_markers() : probe_design.cxx
• distance_analysis_cb() : NT_branchAnalysis.cxx
• distribute_masters() : adseqcompr.cxx
• distribute_xdata() : TranslateRealign.cxx
• dli_dki() : arb_dnarates.cxx
• dna2idx() : AP_codon_table.cxx
• do_align() : ClustalV.cxx
• do_combine() : AP_seq_dna.cxx
• do_conversion() : main.cxx
• do_countMutations() : AP_seq_dna.cxx
• do_extract_words() : adlang1.cxx
• do_hide_command_for_one_species() : GEN_map.cxx
• do_indent() : SEC_io.cxx
• do_mark_command_for_one_species() : GEN_map.cxx
• do_sth_with_species() : ED4_root.cxx
• dont_announce_done() : macro_gui.cxx
• dont_return_unchanged() : ED4_block.cxx
• dontAllowOversize() : insdel.cxx
• dot() : trnsprob.cxx
• dot_missing_bases() : ED4_dots.cxx
• dot_sequence_by_consensus() : ED4_dots.cxx
• double_click_group_cb() : NT_group_search.cxx
• double_cmp() : arbtools.h
• double_diff_2_cmp() : arbtools.h
• downheap() : admap.cxx , adoptimize.cxx
• downheap2() : adoptimize.cxx
• drag_scroll_bar_horizontal() : AW_window.cxx
• drag_scroll_bar_vertical() : AW_window.cxx
• drawIsland() : align.cxx
• drawLowerPath() : align.cxx
• drawPath() : align.cxx
• DrawStructure() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx
• drop_dots() : MG_adapt_ali.cxx
• dummy_db_cb() : ad_cb.cxx
• dump_hexbyte() : awt_hexdump.hxx
• dump_internal() : adTest.cxx
• dump_POS_TREE_special() : PT_debug.cxx
• dump_stdout() : AW_root.cxx
• dump_token_recursive() : aisc_var_ref.c
• dumpDepths() : rns.h , rns.c
• dumpError() : adcomm.cxx
• dumpRNS() : rns.c
• dumpSeqList() : readseq.c
• dumpStreams() : gb_aci.cxx
• dupComplement() : GEN_interface.cxx
• dupRNS() : rns.c
• dupSizedPart() : GEN_interface.cxx