Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

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I : align.cxx
I_fp : f2c.h
I_WRAP_SONAME_FNNAME_ZU : valgrind.h
I_WRAP_SONAME_FNNAME_ZZ : valgrind.h
id : AliAdmin.cxx
ID : di_foundclusters.hxx
ID2IDMap : ps_defs.hxx
ID2IDMapCIter : ps_defs.hxx
ID2IDMapIter : ps_defs.hxx
ID2IDPair : ps_defs.hxx
ID2IDSet : ps_defs.hxx
ID2IDSetCIter : ps_defs.hxx
ID2IDSetIter : ps_defs.hxx
ID2IndexSetPair : ps_candidate.hxx
ID2IndexSetSet : ps_candidate.hxx
ID2IndexSetSetCIter : ps_candidate.hxx
ID2IndexSetSetCRIter : ps_candidate.hxx
ID2IndexSetSetIter : ps_candidate.hxx
ID2IndexSetSetRIter : ps_candidate.hxx
ID2NameMap : ps_defs.hxx
ID2NameMapCIter : ps_defs.hxx
ID2NameMapIter : ps_defs.hxx
id_assert : insdel.cxx
identify_gb_item() : adlang1.cxx
identity() : trnsprob.cxx
IDID2IDSetMap : ps_defs.hxx
IDID2IDSetMapCIter : ps_defs.hxx
IDID2IDSetMapIter : ps_defs.hxx
IDID2NodeMap : ps_detect_weak_differences.cxx
IDID2NodeMapCIter : ps_detect_weak_differences.cxx
IDID2NodeMapIter : ps_detect_weak_differences.cxx
idle_interrupt : dbserver.cxx
IDSet : ps_defs.hxx
IDSetCIter : ps_defs.hxx
IDSetIter : ps_defs.hxx
IDT_SAI : insdel.cxx
IDT_SECSTRUCT : insdel.cxx
IDT_SPECIES : insdel.cxx
IDVector : ps_defs.hxx
IDVectorCIter : ps_defs.hxx
IDVectorIter : ps_defs.hxx
idx2dna() : AP_codon_table.cxx
idx2side() : AP_tree_nlen.cxx
if : AW_awar.cxx
IF_ASSERTION_USED : arb_assert.h
IF_DEBUG : arb_assert.h
IF_DUMP_ACTION : dbserver.cxx
IF_DUMP_AUTH : dbserver.cxx
IF_DUMP_HANDSHAKE : adtools.cxx
IF_MATRIX_DUMP : ClustalV.cxx
IF_NDEBUG : arb_assert.h
IF_TRACE_INOTIFY : AW_inotify.cxx
IFS_VARIABLES : awti_imp_local.hxx
ignore_arb_prop() : AW_root.cxx
ignore_color_value_change : AW_preset.cxx
ignore_selected_SAI_changes_cb : ED4_cursor.cxx
ignore_selected_species_changes_cb : ED4_cursor.cxx
ignoreRuleDetailChange : xfergui.cxx
ignoreRulesetAwarChange : xfergui.cxx
ih_assert : island_hopping.cxx , trnsprob.cxx
ILEU : AP_seq_simple_pro.hxx
ILL_CODE : iupac.cxx
ILLEGAL : query_expr.h
ILLEGAL_VALUE : adperl.cxx
imemerr() : admalloc.cxx
IMP_GENOME_FLATFILE : awti_import.hxx
IMP_PLAIN_SEQUENCE : awti_import.hxx
IMPL_FORMATVALUE_CMD : NT_tree_cmp.cxx
IMPL_OMA_SLOW_LOWMEM : AP_seq_protein.cxx
implicated : arb_assert.h
IMPORT : NT_main.cxx
import_and_continue_cb() : AWTI_import.cxx
import_file_changed_cb() : AWTI_edit.cxx
import_structure_from_file() : SEC_main.cxx
import_window_close_cb() : AWTI_import.cxx
importer : AWTI_import.cxx
importerWarning() : DBwriter.cxx
imtql1_() : eispack.cxx
imtql2_() : eispack.cxx
imtqlv_() : eispack.cxx
IN_2_OUT : gb_aci_impl.h
in_aci_awar_callback : saicalc.cxx
in_awar_changed_callback : AWT_input_mask.cxx
in_boolchain_awar_callback : saicalc.cxx
in_boolchain_inputCharset_awar_callback : saicalc.cxx
in_colorDefChanged_callback : ED4_visualizeSAI.cxx , SaiProbeVisualization.cxx
in_export_filename_changed_cb : AWTI_export.cxx
in_field_changed_callback : AWT_input_mask.cxx
in_global_awar_cb : AW_global_awars.cxx
in_item_changed_callback : AWT_input_mask.cxx
in_matrix_awar_callback : saicalc.cxx
in_pre_update : nds.cxx
in_translate_awar_callback : saicalc.cxx
INC_DEC : chartable.cxx
inc_insert_progress() : CT_dtree.cxx
inCallback : ED4_visualizeSAI.cxx
INCH : AWT_canio.cxx
inch2mm() : AWT_canio.cxx
include_wrapper : mkptypes.cxx
INCR_DIFFER : adoptimize.cxx
indentTo() : TreeWrite.cxx
index2level() : ED4_objspec.cxx
INDEX_BITS : adoptimize.cxx
INDEX_DICT_OFFSET() : adoptimize.cxx
INDEX_LEN_BITS : adoptimize.cxx
INDEX_LEN_SHIFT : adoptimize.cxx
INDEX_SHIFT : adoptimize.cxx
indexout : readseq.c
INFINIT : ali_prealigner.cxx
INFINITE : ed4_defs.hxx
info : arb_dnarates.cxx
info2bio() : arb_defs.h
INFO_FORM : aw_window_Xm.hxx
INFO_TERM_TEXT_YOFFSET : ed4_defs.hxx , ED4_main.cxx
INFO_WIDGET : aw_window_Xm.hxx
INFO_WIDTH : db_scanner.cxx
INFRONTOF : insdel.h
init : ARB_ext.c , DI_matr.cxx
init_Advisor() : AW_advice.cxx , aw_advice.hxx
init_alignments() : MG_preserves.cxx
init_bond_matrix() : PT_extern.c
init_buffer() : arbdb.cxx
init_config_admin_awars() : NT_edconf.cxx
init_config_awars() : NT_edconf.cxx
init_data() : db_server.cxx
init_file_printing() : arb_a2ps.c
init_flag_awars() : ED4_flags.cxx
init_gene_species_xfer_fields_config() : MG_gene_species.cxx
init_gene_species_xfer_fields_subconfig() : MG_gene_species.cxx
init_gpp() : adali.cxx
init_indices_and_count_sons() : adseqcompr.cxx
init_itemspecific_DBUI_awars() : ui_species.cxx
init_itemType_specific_window() : items.h , itemtools.cxx
init_local_com_struct() : probe_design.cxx , arb_probe.cxx
init_myers() : ClustalV.cxx
init_preserve_awars() : MG_preserves.cxx
init_rule_definition_awars() : xfergui.cxx
init_show_pair() : ClustalV.cxx
init_static() : probe_tree.h
init_system3_tab() : MP_noclass.cxx
init_tmp_branch() : ad_load.cxx
INIT_TYPE_NAME : arbdb.cxx
initBaseLookups() : base.c , base.h
initBaseSpecificProbs() : rns.c
InitCallBacks() : RNA3D_Interface.cxx
initEntropy() : align.cxx
initExtensions() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx
initFrand() : frand.c , frand.h
Initialize() : GLwDrawA.c
initialize_IUPAC_add() : iupac.cxx
initialized : AW_advice.cxx , AW_global_awars.cxx
InitializeOpenGLEngine() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx , RNA3D_OpenGLEngine.hxx
InitializeOpenGLWindow() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx , RNA3D_OpenGLEngine.hxx
initializeResources : GLwDrawA.c
InitNASeq() : GDE_FileIO.cxx , GDE_proto.h
initrav() : arb_dnarates.cxx
initScore() : align.cxx
INITSEQ : seq.h
initTrnsprob() : trnsprob.cxx , trnsprob.h
initXferAwars() : xfergui.cxx
inject_STDIN() : phylip.cxx
INNER_HEIGHT : ED4_cursor.cxx
INPLACE_COPY_RECONSTRUCT : arbtools.h
INPLACE_RECONSTRUCT : arbtools.h
input_cb() : DI_view_matrix.cxx , AW_modal.cxx , aw_window_Xm.hxx
input_event() : AWT_canvas.cxx
INPUT_FIELDS_BY_CLIENT : xfergui.cxx
input_history : AW_modal.cxx
input_history_cb() : AW_modal.cxx , aw_window_Xm.hxx
input_history_insert() : AW_modal.cxx
input_mask_list : AWT_input_mask.cxx
INPUT_SIZE : AW_modal.cxx
inputCharsetChanged_cb() : saicalc.cxx
inputfile : readseq.c
inputfilestore : readseq.c
InputFormatPtr : input_format.h
inputMaskDir() : AWT_input_mask.cxx
inputMaskFullname() : AWT_input_mask.cxx
InputMaskList : AWT_input_mask.cxx
inputweights() : arb_dnarates.cxx
inquote : mkptypes.cxx
ins_ntree() : CT_ntree.cxx
insdel_by_SAI_config_def : NT_ins_col.cxx
insdel_by_SAI_predef_config : NT_ins_col.cxx
insdel_event() : NT_ins_col.cxx
insdel_sai_event() : NT_ins_col.cxx
insDelBuffer : insdel.cxx
insDelBuffer_size : insdel.cxx
InsdelMode : NT_ins_col.cxx
INSERT : NT_ins_col.cxx
insert_all_species_into_tree() : PARS_main.cxx
insert_at() : insdel.cxx
insert_color_collapse_submenu() : TreeCallbacks.cxx
INSERT_FACTOR_DEFAULT : ali_global.cxx
insert_fieldtype_toggles() : ui_species.cxx
insert_gap() : insdel.cxx
insert_genes_of_organism() : arb_gene_probe.cxx
insert_interruption_to_macro_cb() : macro_gui.cxx
insert_macro_menu_entry() : macro_gui.cxx , macros.hxx
insert_mark_topic() : TreeCallbacks.cxx
insert_mark_topics() : TreeCallbacks.cxx
insert_new_species_terminal() : ED4_cursor.cxx
insert_ntree() : CT_ntree.cxx , CT_ntree.hxx
INSERT_ROOT_PATTERN : ED4_search.cxx
insert_search_fields() : ED4_root.cxx
INSERT_SEARCH_FIELDS : ED4_root.cxx
insert_section_header() : TreeDisplay.cxx
insert_species_into_tree() : PARS_main.cxx
insertAligned() : fast_aligner.cxx
insertBase() : fast_aligner.cxx
insertClustalValigned() : fast_aligner.cxx
InsertDatainGDE() : GDE_arbdb_io.cxx
InsertedSpecies : PARS_main.cxx
insertGap() : fast_aligner.cxx
insertionOrder_less() : CT_hash.cxx
INSERTS_NAME : fast_aligner.cxx
insertShapeSelection() : RNA3D_Interface.cxx
insertSlaveBases() : fast_aligner.cxx
InsertSpeciesIterator : PARS_main.cxx
insertsToNextBase() : fast_aligner.cxx
InsertWhere : insdel.h
inside_callback_main : ad_cb.cxx
inside_group_selection : NT_group_search.cxx
inside_shell : arbdb.cxx
INSTALL_CBS : GEN_graphic.hxx
install_config_change_callbacks() : NT_edconf.cxx
install_SigHandler() : SigHandler.h
INSTALL_SIGHANDLER : SigHandler.h
integer : f2c.h
integer1 : f2c.h
INTEGER_MAX : defs.h
INTEGER_MAX2EXP : defs.h
INTEGRATED_ALIGNERS_TITLE : fast_aligner.hxx
interface_cb : SEC_db.cxx
intergene_counter : arb_gene_probe.cxx
interleaved : arb_dnarates.cxx , readseq.c
internal_export_commands : seq_export.cxx
interpret : arb_a2ps.c
INTERSECT : group_search.h
intersection() : pos_range.h
INTERVAL_BORDER_DEFAULT : ali_global.cxx
INTERVAL_CENTER_DEFAULT : ali_global.cxx
intVector : Location.h
INVALID_CB_PARAM_TYPE() : cbtypes.h
INVALID_TABLE_OPERATION : chartable.cxx
INVALID_TYPE : arb_proto_2_xsub.cxx
invalid_use_in_server() : adcomm.cxx
INVALIDATE_IF : ad_cb.cxx
INVERT : GEN_map.cxx , NT_taxonomy.cxx , PRD_Globals.hxx , db_query.cxx
invfreqr : arb_dnarates.cxx
invfreqy : arb_dnarates.cxx
invit_() : eispack.cxx
ipol() : trnsprob.cxx
IRS : irstree_display.cxx
Is : defs.h
Is0 : defs.h
Is1 : defs.h
IS_3_TO_5 : GDE_def.h
IS_5_TO_3 : GDE_def.h
is_abbrev_switch() : main.cxx
is_absolute_path() : adsocket.cxx
is_ali_gap() : seq_search.hxx
is_ambig_base() : probe.h
IS_AMINO : ed4_tools.hxx
is_assert : item_shader.cxx , item_shader.h
is_base : arb_primer.cxx
is_binary_db_id() : ad_load.cxx
is_binaryfile() : arb_a2ps.c
IS_BOLD : arb_a2ps.c
is_cached_taxonomy() : adlang1.cxx
is_chain() : probe_tree.h
is_char() : arb_dnarates.cxx
IS_CIRCULAR : GDE_def.h
is_cluster() : DI_clusters.cxx
is_comment() : recmac.cxx
is_consensus_gap() : ED4_cursor.cxx
IS_CSYM : mkptypes.cxx
is_cursor_keycode() : TreeDisplay.cxx
is_default_or_ignore_sighandler() : SigHandler.h
IS_DNA : ed4_tools.hxx
is_dynamic() : AWTI_import.cxx
is_embl_comment() : embl.cxx
is_empty_code() : arb_proto_2_xsub.cxx
is_end_mark() : global.h
is_end_of_macro() : recmac.cxx
is_EOL() : BufferedFileReader.cxx
is_EOS() : aisc_inline.h
is_equal_to : test_unit.h
is_equal_to_NULL : test_unit.h
is_escaped() : Importer.cxx
is_forward_decl() : arb_proto_2_xsub.cxx
is_Gap() : RNA3D_StructureData.cxx
is_gap() : seq_search.hxx
is_Gap() : BI_basepos.cxx
is_gap_fun : BI_basepos.hxx
is_gapchar() : global.h
is_genbank_date() : date.cxx
is_help_req() : main.cxx
is_hidden_file() : AWTI_import.cxx
is_ID_char() : arb_proto_2_xsub.cxx
is_in_buffer() : arbdb.cxx
is_in_EXPERIMENT_path() : changekey.cxx
is_in_GENE_path() : changekey.cxx
is_in_reserved_path() : changekey.cxx
is_inf() : arbtools.h
is_info() : xfergui.cxx
is_input_format() : fun.h
is_leaf() : probe_tree.h
is_less_or_equal : test_unit.h
is_less_than : test_unit.h
is_LF() : aisc_inline.h
is_LF_EOS() : aisc_inline.h
is_list_style() : TreeDisplay.hxx
is_lower : ureadseq.h
is_marked_as_default_len() : TreeRead.h
is_more_or_equal : test_unit.h
is_more_than : test_unit.h
is_name_of_envvar() : adsocket.cxx
is_named() : ED4_root.cxx
is_nan() : arbtools.h
is_nan_or_inf() : arbtools.h
is_node() : probe_tree.h
is_normal() : arbtools.h
IS_NUCLEOTIDE : ed4_tools.hxx
IS_ORIG_3_TO_5 : GDE_def.h
IS_ORIG_5_TO_3 : GDE_def.h
IS_ORIG_PRIMARY : GDE_def.h
IS_ORIG_SECONDARY : GDE_def.h
IS_PARM_NAME : mkptypes.cxx
is_prefined() : AWT_config_manager.cxx
IS_PRIMARY : GDE_def.h
is_prototype() : arb_proto_2_xsub.cxx
is_pseudo_key() : db_query.cxx
IS_QUERIED_SPECIES : merge.hxx
is_resize_event() : AW_window.cxx
IS_RNA : ed4_tools.hxx
IS_ROMAN : arb_a2ps.c
is_SAI_named() : ED4_root.cxx
is_saved() : probe_tree.h
is_scalable : AW_xfont.cxx
IS_SECONDARY : GDE_def.h
is_SEP() : aisc_inline.h
is_SEP_LF_EOS() : aisc_inline.h
is_sequence_terminator() : global.h
is_similar() : CT_part.hxx
IS_SINGLE_BRANCH_NODE : probe_tree.h
is_SPACE() : aisc_inline.h
is_SPACE_LF() : aisc_inline.h
is_SPACE_LF_EOS() : aisc_inline.h
is_SPACE_SEP_LF_EOS() : aisc_inline.h
is_species_named() : ED4_root.cxx
is_startof_itemlist_element() : arb_help2xml.cxx
is_std_base() : probe.h
is_std_base_or_N() : probe.h
is_tree() : adtree.cxx
is_tree_style() : TreeDisplay.hxx
is_type_word() : mkptypes.cxx
is_typedef() : arb_proto_2_xsub.cxx
is_upper : ureadseq.h
is_valid_base() : probe.h
is_weight : ClustalV.cxx
is_word_char() : global.h
isAnyChar() : ureadseq.c
isCorrectParent() : group_search.cxx
iScreenHeight : RNA3D_OpenGLEngine.cxx
iScreenWidth : RNA3D_OpenGLEngine.cxx
isdatenum() : date.cxx
isDeleted : base.h
isElement() : probe_collection.cxx
isEmptyOrComment() : arb_help2xml.cxx
isGap() : AP_seq_dna.cxx
isgap() : GDE_event.cxx
isGap() : TranslateRealign.cxx , AP_seq_protein.cxx , AP_codon_table.cxx
isHelical : base.h
IsInteger : defs.h
isInternalMaskName() : AWT_input_mask.cxx
isKeyword() : AWT_input_mask.cxx
Island : align.cxx
island_hopper : fast_aligner.cxx
IsList : defs.h
isMackeHeader() : macke.h
isMackeNonSeq() : macke.h
isMackeSeqHeader() : macke.h
isMackeSeqInfo() : macke.h
IsMinus1 : defs.h
ismonth() : date.cxx
IsNegativeInteger : defs.h
IsNegativeNumber : defs.h
IsNumber : defs.h
ISOlatin1 : arb_a2ps.c
isPairing : base.h
IsPositiveInteger : defs.h
IsPositiveNumber : defs.h
isQuoteChar() : TreeWrite.cxx
IsReal : defs.h
isSeqChar() : ureadseq.c
isSeqNumChar() : ureadseq.c
isSignificant() : align.cxx
isStartOrStopCodonNr() : AP_codon_table.cxx
isTU() : GDE_event.cxx
isUnique() : align.cxx
ISVALID : aw_position.hxx
isWhite() : arb_help2xml.cxx
it_assert : items.h
ITEM : arb_help2xml.cxx
item_changed_cb() : AWT_input_mask.cxx
item_check_fun : NT_dbrepair.cxx
item_check_iter : NT_dbrepair.cxx
item_check_map : NT_dbrepair.cxx
item_iterator : adhashtools.cxx
ITEM_organism : species.cxx
ITEM_sai : SAIs.cxx
ITEM_species : species.cxx
item_type_experiment : EXP_main.cxx
item_type_gene : GEN_map.cxx
item_type_species : NT_extern.cxx
itemAwar() : ui_species.cxx
ItemSelector : items.h
itemTypeSpecificWindowID() : itemtools.cxx
iterate() : arb_perf_test.cxx
itobase36() : arb_dnarates.cxx
IUPAC_add : iupac.cxx
IUPAC_add_initialized : iupac.cxx
IUPAC_EMPTY : iupac.cxx
iwhichlist : readseq.c