Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

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• U : align.cxx
• U_fp : f2c.h
• u_str : adoptimize.cxx
• uchar : gde.hxx , probe.h , PT_compress.h , AP_filter.hxx
• udata() : probe_tree.h
• ui_assert : ui_species.cxx
• UINT : GDE_arbdb_io.cxx , probe.h
• uint_16 : PT_tools.h
• uint_32 : PT_tools.h
• uint_64 : PT_tools.h
• uint_8 : PT_tools.h
• uint_big : PT_tools.h
• ULONG : probe.h
• ULSet : ps_eval_candidates.cxx
• unalign() : TranslateRealign.cxx
• unaligned_bases : fast_aligner.cxx
• unattached_message() : arb_help2xml.cxx
• UNCOVERED : arb_assert.h
• UNDEF_CATEGORY : DNAml_rates_1_0.h
• undefine_branchlengths() : AP_tree_edge.cxx
• undo_entry() : adindex.cxx
• unEscapeString() : adlang1.cxx
• UNFIXED : cb_base.h
• unGetLine() : ureadseq.c
• unifyCluster() : Cma.cxx
• uninitEntropy() : align.cxx
• uninitScore() : align.cxx
• uninitTrnsprob() : trnsprob.cxx , trnsprob.h
• UNINSTALL_SIGHANDLER : SigHandler.h
• uninstall_SigHandler() : SigHandler.h
• uniqueID() : GDE_HGLfile.cxx , GDE_proto.h
• UNITE : group_search.h
• UnitTest_function : UnitTester.hxx
• UNITTEST_return_after_segv : UnitTester.cxx
• UNITTEST_sigsegv_handler() : UnitTester.cxx
• unitTesterDir() : TestEnvironment.cxx
• UnitTestResult : UnitTester.hxx
• UNIVERSAL : di_protdist.hxx
• UNK : AP_seq_simple_pro.hxx
• UNKNOWN : fun.h , TestEnvironment.cxx
• UNKNOWN_ACID : ClustalV.cxx
• UNKNOWN_ARG : NT_main.cxx
• UNKNOWN_LENGTH : sized_cstr.h
• UNKNOWN_TYPEINFO : GDE_menu.h
• UnknownOption() : mkptypes.cxx
• unlikely : DNAml_rates_1_0.h
• unlink_awar_from_DB() : AW_root.cxx
• unlink_cache_entry() : adcache.cxx
• unlink_mask_from_database() : AWT_input_mask.cxx
• unlock_detached_cb() : info_window.cxx
• UNMARK : GEN_map.cxx , NT_taxonomy.cxx , db_query.cxx
• unmark_branches_cb() : NT_branchAnalysis.cxx
• unmark_species() : NT_edconf.cxx
• UNPAIRED_HELIX_A : RNA3D_StructureData.hxx
• UNPAIRED_HELIX_C : RNA3D_StructureData.hxx
• UNPAIRED_HELIX_G : RNA3D_StructureData.hxx
• UNPAIRED_HELIX_U : RNA3D_StructureData.hxx
• UNREAD_BY_RULESET : xfergui.cxx
• UNROOTED : arbdbt.h
• unsigned_char : adoptimize.cxx
• UNSORTED : di_foundclusters.hxx
• UntypedCallbackData : cbtypes.h
• UNUSED : cxxforward.h
• UNWRITTEN_BY_RULESET : xfergui.cxx
• upcase() : prototypes.h , util.cxx , TestEnvironment.cxx
• update_all() : DI_clusters.cxx
• update_cb() : DI_matr.cxx
• update_ClrTransTabNamesList_cb() : ED4_visualizeSAI.cxx
• update_cluster_group() : DI_clusters.cxx
• update_cluster_sellist() : DI_clusters.cxx
• update_colorset_selection_list() : db_query.cxx
• update_default_treename_cb() : ad_trees.cxx
• UPDATE_DELAY : DI_matr.cxx
• update_display_on_dist_change : DI_view_matrix.cxx
• update_example() : DI_clusters.cxx
• update_exportTest_result_cb() : AWTI_edit.cxx
• update_extension_size() : ED4_no_class.cxx
• update_filter_cb() : ad_trees.cxx
• update_format_description() : AWTI_import.cxx
• update_format_description_and_suffix() : AWTI_export.cxx
• update_group_folding() : ED4_no_class.cxx
• update_HelixNrDispList() : RNA3D_OpenGLEngine.cxx
• update_import_filename_cb() : AWTI_edit.cxx
• update_location_from_GEN_position() : GEN_interface.cxx
• update_macro_record_button() : macro_gui.cxx
• update_main_window_title() : NT_extern.cxx
• update_min_mutations() : AP_seq_protein.cxx
• update_on_config_change_cb() : PH_filt.cxx
• update_pos_awars : SEC_db.cxx
• update_ptserver_button() : AWT_sel_boxes.cxx
• update_random_repeat() : PARS_main.cxx
• update_RangeList() : NT_ins_col.cxx
• update_RangeList_cb() : NT_ins_col.cxx
• update_rectangle() : ED4_window.cxx
• update_reference_settings() : ED4_seq_colors.cxx
• update_restore_label() : DI_clusters.cxx
• update_rulesAwar() : saicalc.cxx
• update_scrolled_rectangles() : ED4_manager.cxx
• update_undefined_leaf_branchlength() : AP_tree_edge.cxx
• updateChangedInputFields() : xfergui.cxx
• updateEntropy() : align.cxx
• updateScore() : align.cxx
• updateTrnsprob() : trnsprob.h , trnsprob.cxx
• updateValNameList() : NT_validManual.cxx
• uplinks : AW_help.cxx
• UPPER : adlang1.cxx
• UPPER_OFFSET : ED4_cursor.cxx
• uppercase() : arb_dnarates.cxx
• UPPERCASE : names.cxx
• uprootTree() : arb_dnarates.cxx
• url_host_matches() : AWT_www.cxx
• usage() : arb_a2ps.c , names.cxx , readseq.c
• Usage() : mkptypes.cxx
• USE : GLwDrawA.c
• USE_ARB_CRC_HASH : gb_hashindex.h
• use_editor_range_cb() : NT_split_ali.cxx
• use_macro : mkptypes.cxx
• use_main : mkptypes.cxx
• use_other_path_buf() : adsocket.cxx
• use_selected_as_target_cb() : saicalc.cxx , ad_trees.cxx
• USE_SPECIFIED_FAMILY_DEFAULT : ali_global.cxx
• USE_STATPOLL : AW_inotify.cxx
• USEC : arb_sleep.h
• used_sina_interface : graph_aligner_gui.cxx
• usedxtip : arb_dnarates.cxx
• user_code_nr_changed_cb() : AP_pro_a_nucs.cxx
• UseRange : insdel.h
• userdef_DNA_matrix : DI_matr.cxx
• UserFrameStack : ap_main_type.hxx
• USERINPUT_BUFFERSIZE : readseq.c
• USERINPUT_BUFFERSIZE_SEQ : readseq.c
• userweights : arb_dnarates.cxx
• useSelectedAlignment() : NT_concatenate.cxx
• USSet : ps_eval_candidates.cxx
• ut_assert : UnitTester.cxx