- c -

• C : trnsprob.h
• CANT_HANDLE : arb_proto_2_xsub.cxx
• CAPS : adlang1.cxx
• CHECK_DIMENSION_CHANGE : item_shader.h
• CHEMICAL : di_protdist.hxx
• CI_CLOSE_GROUP : ad_config.h
• CI_END_OF_CONFIG : ad_config.h
• CI_FOLDED_GROUP : ad_config.h
• CI_GROUP : ad_config.h
• CI_SAI : ad_config.h
• CI_SPECIES : ad_config.h
• CI_UNKNOWN : ad_config.h
• CILIATE : di_protdist.hxx
• CIRCLE : RNA3D_Textures.hxx
• CL_BRANCH : TreeDisplay.hxx
• CL_FLAG : TreeDisplay.hxx
• CL_NODE : TreeDisplay.hxx
• CL_ROOTNODE : TreeDisplay.hxx
• CL_RULER : TreeDisplay.hxx
• CL_SPECIES : TreeDisplay.hxx
• CLEAN : TestEnvironment.cxx
• CLICK_SELECT_SPECIES : DI_view_matrix.cxx
• CLICK_SET_MINMAX : DI_view_matrix.cxx
• CM_COPY_FULL : arbdb.cxx
• CM_COPY_STANDARD : arbdb.cxx
• CM_COPY_TRADITIONAL : arbdb.cxx
• CM_COPY_WITHPROTECT : arbdb.cxx
• CM_DROP_MARKS : arbdb.cxx
• CM_DROP_PROTECTION : arbdb.cxx
• CM_DROP_TEMPSTATE : arbdb.cxx
• CM_MATCH : group_search.h
• CM_MISMATCH : group_search.h
• CM_OVERWRITE_EXISTING : arbdb.cxx
• CM_SKIP_TEMP : arbdb.cxx
• CMD_ASSIGN : AWT_input_mask.cxx
• CMD_CHANGEMASK : AWT_input_mask.cxx
• CMD_CHECKBOX : AWT_input_mask.cxx
• CMD_GLOBAL : AWT_input_mask.cxx
• CMD_ID : AWT_input_mask.cxx
• CMD_LOCAL : AWT_input_mask.cxx
• CMD_NEW_LINE : AWT_input_mask.cxx
• CMD_NEW_SECTION : AWT_input_mask.cxx
• CMD_NUMFIELD : AWT_input_mask.cxx
• CMD_OPENMASK : AWT_input_mask.cxx
• CMD_RADIO : AWT_input_mask.cxx
• CMD_SCRIPT : AWT_input_mask.cxx
• CMD_SELF : AWT_input_mask.cxx
• CMD_SHOW : AWT_input_mask.cxx
• CMD_TEXT : AWT_input_mask.cxx
• CMD_TEXTFIELD : AWT_input_mask.cxx
• CMD_UNKNOWN : AWT_input_mask.cxx
• CMD_WWW : AWT_input_mask.cxx
• CMM_ALL : di_foundclusters.hxx
• CMM_ALL_BUT_REP : di_foundclusters.hxx
• CMM_ONLY_REP : di_foundclusters.hxx
• CO_AND : group_search.h
• CO_IGNORE : group_search.h
• CO_OR : group_search.h
• COLLAPSE_ALL : TreeDisplay.hxx
• COLLAPSE_TERMINAL : TreeDisplay.hxx
• COLOR_SYNC_ALL : SEC_main.cxx
• COLOR_SYNC_RANGE : SEC_main.cxx
• COLOR_SYNC_REST : SEC_main.cxx
• COLOR_SYNC_SEARCH : SEC_main.cxx
• COMMON : NT_taxonomy.cxx
• COMPARE_TOPOLOGY : NT_tree_cmp.h
• COMPRESS_ALL : GDE_extglob.h
• COMPRESS_NONE : GDE_extglob.h
• COMPRESS_NONINFO_COLUMNS : GDE_extglob.h
• COMPRESS_VERTICAL_GAPS : GDE_extglob.h
• CONE_DOWN : RNA3D_Textures.hxx
• CONE_UP : RNA3D_Textures.hxx
• CONF_COMBINE : NT_edconf.cxx
• CONF_EXTRACT : NT_edconf.cxx
• CONF_INVERT : NT_edconf.cxx
• CONF_MARK : NT_edconf.cxx
• CONF_UNMARK : NT_edconf.cxx
• CONFIG_AWARS : AWT_config_manager.cxx
• CONST_CHAR : arb_proto_2_xsub.cxx
• CONTAINS : NT_ins_col.cxx
• CONVERSION_FUNCTION : arb_proto_2_xsub.cxx
• COPY : adali.cxx , AWTI_edit.cxx
• COPY_RULESET : xfergui.cxx
• COPY_SPECIES : ed4_class.hxx
• COUNT_DONT_USE_MAX : phylo.hxx
• CR_CREATED : aw_inotify.hxx
• CR_DELETED : aw_inotify.hxx
• CR_MODIFIED : aw_inotify.hxx
• CREATE_FROM_CONSENSUS : ed4_class.hxx
• CREATE_NEW_SPECIES : ed4_class.hxx
• CRM_COPY : AdminGui.cxx
• CRM_RENAME : AdminGui.cxx
• CROSS : RNA3D_Textures.hxx
• CS_CLEAR : SQ_functions.cxx
• CS_IS_CLUSTER : di_clustertree.hxx
• CS_MAYBE_CLUSTER : di_clustertree.hxx
• CS_NO_CLUSTER : di_clustertree.hxx
• CS_PASS1 : SQ_functions.cxx
• CS_SUB_CLUSTER : di_clustertree.hxx
• CS_TOO_SMALL : di_clustertree.hxx
• CS_UNKNOWN : di_clustertree.hxx
• CT_AID : group_search.h
• CT_ELSE : aisc_parser.h
• CT_ELSEIF : aisc_parser.h
• CT_ENDFOR : aisc_parser.h
• CT_ENDIF : aisc_parser.h
• CT_FOLDED : group_search.h
• CT_FOR : aisc_parser.h
• CT_FUNCTION : aisc_parser.h
• CT_IF : aisc_parser.h
• CT_KEELED : group_search.h
• CT_LABEL : aisc_parser.h
• CT_MARKED : group_search.h
• CT_MARKED_PC : group_search.h
• CT_NAME : group_search.h
• CT_NESTING_LEVEL : group_search.h
• CT_NEXT : aisc_parser.h
• CT_OTHER_CMD : aisc_parser.h
• CT_PARENT_ALL : group_search.h
• CT_PARENT_ANY : group_search.h
• CT_PARENT_DIRECT : group_search.h
• CT_SIZE : group_search.h
• CT_ZOMBIES : group_search.h
• CURRENT_CFG : AWT_config_manager.cxx
• CYS : AP_seq_simple_pro.hxx