ARB
|
This is the complete list of members for SQ_GroupData, including all inherited members.
avg_bases | SQ_GroupData | protected |
clone() const =0 | SQ_GroupData | pure virtual |
gc_prop | SQ_GroupData | protected |
getSize() const | SQ_GroupData | inline |
initialized | SQ_GroupData | protected |
nr_sequences | SQ_GroupData | protected |
operator=(const SQ_GroupData &other)=0 | SQ_GroupData | pure virtual |
size | SQ_GroupData | protected |
SQ_add(const SQ_GroupData &other)=0 | SQ_GroupData | pure virtual |
SQ_add_sequence(const char *sequence)=0 | SQ_GroupData | pure virtual |
SQ_calc_consensus(const char *sequence) const =0 | SQ_GroupData | pure virtual |
SQ_count_sequences() | SQ_GroupData | inline |
SQ_get_avg_bases() const | SQ_GroupData | inline |
SQ_get_avg_gc() const | SQ_GroupData | inline |
SQ_get_nr_sequences() const | SQ_GroupData | inline |
SQ_GroupData() | SQ_GroupData | |
SQ_init_consensus(int size)=0 | SQ_GroupData | pure virtual |
SQ_is_initialized() const | SQ_GroupData | inline |
SQ_print_on_screen()=0 | SQ_GroupData | pure virtual |
SQ_set_avg_bases(int bases) | SQ_GroupData | inline |
SQ_set_avg_gc(double gc) | SQ_GroupData | inline |
~SQ_GroupData() | SQ_GroupData | virtual |